输尿管结石伴有肾积水，提示已出现梗阻性肾病，建议积极排石治疗，尽早解除梗阻。根据结石的大小，可以采取内科治疗和外科治疗。如果结石直径小于0.6cm，一般通过应用解痉的药物，比如654-2，钙离子拮抗剂，多饮水，多运动可以排除体外。如果结石超过0.8cm，就要采取外科治疗，比如体外震波碎石，或者是输尿管镜，或者是开放手术治疗。
中医治疗肾结石和输尿管结石效果不好，肾结石的形成是由于尿中晶体物质浓度升高，析出结晶并在局部生长、聚集的结果，结石活动会出现疼痛和血尿，中医中药有促进结石排出作用，常用于辅助治疗。
可以进行彩超检查，如果是小结石，可以口服排石的药物，要多喝水，多蹦蹦跳跳来促进排出，其次可以手术治疗，在药物治疗的同时，要多喝水，平时的饮食要以清淡、营养为主，不可以吃辛辣刺激性食物的慑入，以免不利于恢复的。
肾结石输尿管结石，均为上尿路的结石，根据结石的性质，形状，大小，部位不同，治疗方案是有很大差异的，如果结石比较小，小于0.6厘米，没有泌尿系的感染，没有泌尿系梗阻的情况，可以先口服排石汤等进行保守治疗，如果结石小于0.4厘米，90%是能够自行排出的。
肾结石和输尿管结石都是泌尿系结石的一个疾病名称，实际上是比较相似的，区别就是结石生长的部位的不同，而区分为肾脏的结石，叫肾结石，输尿管的结石叫做输尿管结石，输尿管和肾脏是连在一起的，也有可能是肾结石的结石掉进了输尿管形成输尿管结石的。
当中可以多吃一些含钾的水果食物，比如西瓜、香蕉等，西瓜是具有利尿的作用，再加上水分比较大，所以吃西瓜和排尿量会增加，此外西瓜的利尿作用还能使盐分排出体外，减少肾结石的形成。