卵巢囊肿是有可能影响怀孕的，卵巢囊肿是卵巢肿瘤的一种，卵巢是卵子发育、成熟、排出的场所，当卵巢受到破坏时是会造成不育的，如果同时伴有进行性加重的痛经及性交痛、盆腔有触痛性结节，则应考虑子宫内膜异位症（即巧克力囊肿），采取不同的治疗。
一般情况下，左侧卵巢囊肿是否会不孕需根据实际情况来判断，具体内容如下：
彩超显示有卵巢囊肿是左边的，要看囊肿的大小和类型。女性在女性体内排卵后，左侧卵巢囊肿低于三公分，一般不会对妊娠造成什么不良反应。如果是左边的卵巢有不规则的回音，或是出现了分格，又或是进行性的痛经，那么就需要怀疑是巧克力囊肿的表现。
巢囊肿一般是内分泌失调引起的，属于良性病变，生长缓慢，如果小于6个厘米，可以先观察，暂时不用手术治疗。建议平时养成良好的生活习惯，适当锻炼，增强体质，肥胖，适当减肥，过度肥胖对卵巢功能是有影响的。保持良好的心情，不要过度紧张。
卵巢囊肿下腹会有充胀、下坠、疼痛感，还会出现食欲不振、呕吐、体重减轻、发烧的情况，严重的甚至会导致腹部与四肢发生水肿，影响正常生活。若是出现腹部有肿块、阴道不正常的出血以及下腹不适的情况发生，就要留意是否是卵巢出现病变的原因。
症状有阴道异常分泌物，当子宫生长肿瘤如子宫肌瘤、子宫内膜癌、子宫肉瘤、绒毛膜癌时，可出现月经的异常，包括月经量过多，周期紊乱失去规律，月经持续时间延长，淋漓出血等。
一侧卵巢囊肿通常不会不孕。
女性生殖器官的肿瘤是卵巢囊肿，与生活不规律、经常性熬夜、内分泌紊乱等原因引起的，但是并不会对女性的生理周期和排卵造成一定的负面影响。需要注意的是，在怀孕期间出现了卵巢囊肿，需要在主治医师的指导下进行治疗，等病情完全稳定之后才能生育，可以口服药物联合微波局部理疗，也可以考虑外科手术，否则怀孕时囊肿会变得越来越大，从而导致怀孕。