抗甲状腺过氧化物酶抗体高，在多种自身免疫性甲状腺疾病中，都会出现升高，但是其升高的程度是不一样的。如果升高比较明显，要首先考虑自身免疫性甲状腺炎，比如桥本甲状腺炎。如果是轻度或者中度程度的升高，则考虑甲亢等疾病。所以甲状腺过氧化物酶抗体的水平，可以与其他甲功指标综合评估甲状腺疾病的病因。
可能是甲状腺疾病：如自身免疫性甲状腺疾病、萎缩性甲状腺炎、产后甲状腺炎等导致的。也可能是非甲状腺疾病：如弥漫性结缔组织病也可见抗甲状腺过氧化物酶抗体增高。也考虑是生理性增高：正常老年女性可能会有抗甲状腺过氧化物酶抗体轻度增高的现象。
甲状腺抗过氧化物酶抗体升高，提示以下几点。
第一，自身免疫性甲状腺疾病，如桥本甲状腺炎、毒性弥漫性甲状腺肿，也就是Graves病。
第二，其他自身免疫性疾病也可表现为甲状腺抗过氧化物酶抗体升高，如类风湿关节炎、系统性红斑狼疮。
甲状腺抗过氧化物酶抗体主要是甲状腺细胞受损后，细胞内甲状腺过氧化物酶进入血液，刺激机体产生自身免疫性甲状腺炎的标记抗体，与甲状腺球蛋白抗体的临床意义相同，但甲状腺过氧化物酶抗体的敏感性和特异性高于甲状腺球蛋白抗体。
怀孕之后若测定甲状腺功能的结果为抗甲状腺过氧化物酶抗体高，说明存在甲状腺的自身免疫因素。说明体内存在有抗甲状腺过氧化物酶抗体。单纯的甲状腺过氧化物酶抗体升高，并不严重。
甲状腺过氧化物酶抗体低，往往是正常的生理现象，不是疾病。
甲状腺过氧化物酶是甲状腺微粒体的主要抗原成分，其功能与甲状腺激素的合成有关。抗甲状腺过氧化物酶抗体的存在可能损伤甲状腺细胞。因此，正常人体内可以或存在较少的该抗体。抗甲状腺过氧化物酶抗体低，伴血清免疫球蛋白减少，经常感冒，可能与自身免疫力低下有关。建议患者养成生活习惯，避免熬夜，适当进行慢跑、跳绳、游泳等运动，增强体质，提高机体免疫力，改善状况，有助于防病。
抗甲状腺过氧化酶抗体是甲状腺功能化验结果中的一项，如果化验抗甲状腺过氧化酶抗体偏高需要结合甲功以明确现有的病情，发现甲状腺肿大或者甲状腺功能异常的时候，都需检查甲状腺激素水平，还有甲状腺过氧化物酶抗体和甲状腺球蛋白抗体。