本来是应该只存在于子宫内，子宫内膜具有根据体内激素水平的变化周期性增殖、脱落而形成月经。子宫内膜出现在别的地方。出现在其他地方的子宫内膜也和处于子宫内的子宫内膜一样，具有周期性增殖、脱落的规律。
卵巢巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种类型，可引起进行性痛经和不孕。引起巧克力卵巢囊肿的原因很多，要去当地正规专业医院进行检查确诊后及时治疗。选择合适的治疗方法都是可以的。
一般卵巢巧克力囊肿就是子宫内膜异位症导致的，另外巧克力囊肿住院治疗应是看看大小的，一般的手术需要住院，大于5cm需要积极手术。调养气血。手术需要保养，住院1-2周比较好的。注意调养生活的习惯，忌辛辣的食物。
巧克力囊肿用中药治疗能治好，巧克力囊肿是因为子宫内膜异位到卵巢引起的，很容易引起排卵异常，影响怀孕。平时要注意调整自己的情绪，保持乐观开朗的心态，使机体免疫系统的功能正常。
巧克力囊肿治疗之后又很容易复发，会带来巨大痛苦。腹腔镜手术是诊断子宫内膜异位症的方法。但手术后，人体会恢复排卵，发挥内分泌功能，残存的内膜又会开始生长，所以手术后尽早怀孕，因为怀孕后至少有一年的时间可以让这些内膜组织因为没有雌激素而逐渐衰退而被吸收掉。
如果病人的巧克力囊肿没有别的病变，是可以治好的，大多数采取药物治疗和手术治疗，其中药物治疗，保守治疗复发率相当的高，也可以结合中医，比如吃一些活血化瘀，散结的中药。