沙眼衣原体感染的治疗目的是治疗感染，防止产生合并症，阻断进一步传播。治疗原则是早期发现早期治疗，足疗程足量用药，性伴侣须同时治疗。要勤洗澡，不提倡洗盆浴，衣物要单独存放；要经常换洗内裤，特别是新内裤或长久不穿的内裤，穿之前要清洗晾晒；穿透气好、吸湿性强的棉织品内裤，尽量少穿紧身裤或牛仔裤，多穿透气性好的裙装，这对保护女性身体健康是非常重要的。
沙眼衣原体尿道炎能根治。
沙眼衣原体尿道炎属于是非淋性的尿路感染，大多数是可以治好的，要积极配合医生进行治疗。确诊后，患者需要遵医嘱采用广谱抗生素治疗，并且要规则、定量、彻底治疗，要连续不间断用药，才能够达到根治的效果。患者还要做好日常护理，保持局部清洁卫生。
沙眼衣原体是男性尿道的常见致病菌，潜伏期1～3周，临床表现为尿道粘液性或粘液脓性分泌物，并有尿痛、尿道不适等症状，急性发作时尿道口发红的，可以提取分泌物进行化验，选择敏感的抗生素，在药物治疗的同时，要保持个人的清洁卫生，大量饮水，在药物治疗的同时，最近的饮食要以清淡为主，不可以吃辛辣刺激性食物。
尿道炎常见症状有尿频、尿急、尿痛，可有尿道分泌物，初始为黏液性，后多有量脓性分泌物。宫颈炎主要症状为阴道分泌物增多，呈粘液脓性，阴道分泌物的刺激可引起外阴瘙痒，伴有腰酸及下腹部坠痛。
饮酒会导致尿道炎症的恶化，不存在易感性的情况下饮酒并不会导致尿道炎。因此，在平时一定要做到戒烟戒酒，并且要在医师的指导下使用敏感性的药物来进行抗菌药物。患者平时要多饮水，每天尿水量在2000ml以上，平时要多排尿，尽量不要憋尿，保持2个小时左右排尿一次，尿液对尿路有很好的冲洗效果，有利于细菌等的排出，有利于身体的康复。在日常生活中要多吃一些新鲜的蔬菜，避免食用辛辣刺激的食品。日常的作息要有一定的规律，在急性期要多注意多休息，保持良好的个人清洁，在治疗过程中尽量不要同房。
