肛瘘引起原因与肛周脓肿、直肠肛门损伤、肛门裂反复感染等有关，由于生活习惯有长期便秘，经常食用刺激性的食物，上厕所时喜欢长期蹲厕所，都是肛瘘的致病因素。可以先用药物治疗，如果药物治疗效果不好，可以选择手术治疗。饮食注意宜食富含纤维素的食物，忌食辛辣、油炸食品，保持排便通畅。
肛瘘多是由于直肠肛管周围脓肿引起，当炎症严重、深部脓肿或脓肿引流不畅，或者肥胖及患有糖尿病，才容易形成肛瘘。内口多在齿状线上肛窦处，脓肿自行破溃或切开引流处形成外口，位于肛周皮肤上。
肛瘘如果多次反复发作，脓液可穿破管壁顺括约肌间隙蔓延而形成多发性、复杂性肛瘘，不但给治疗带来了困难，而且也影响到肛门的正常生理功能。还有肛瘘的多发性，可形成直肠阴道瘘、直肠尿道瘘和直肠膀肤瘘，危及周围脏器。并且肛瘘有恶变倾向。
一般可能是痔疮引起的，痔疮主要是看轻重的程度，一定要调整饮食生活规律，多食用富含纤维的食物。多吃蔬菜水果谷类。还可以促进肠蠕动利于排便。不要吃辛辣油腻的东西，酒咖啡也尽量少喝。
流脓：脓液多少与瘘管大小、长短及数目有关。新形成或炎症急性发作期的瘘管脓多、味臭、色黄而浓厚，经久不愈的瘘管脓液较少或时有时无。脓液急剧增多，局部脓肿，体温增高。常因肛瘘炎症急性发作或有支管形成。结核性肛瘘脓液多而清稀，呈米泔水样，可有干酪样坏死物。肿块：肛缘索条状硬块。