乙肝大三阳与小三阳之间存在差异，大三阳表明病毒复制较活跃，传染性相对较强。
小三阳一般提示病情处于慢性化，传染性较弱。当然，对乙肝患者来说，也以大三阳或小三阳为准，及乙肝DNA和其他有关数值，对疾病进行全面的分析和判断，及抗病毒治疗方案的指导。临床上主要使用的是拉米夫定联合利巴韦林进行抗病毒治疗。当前乙肝患者在接受了正规抗病毒治疗后，病情很平稳，而抗病毒治疗则需长期服药，现在口服药物治疗时间至少为4年，部分病人需终身服药。
所谓的大小三阳指的是乙肝免疫指标中e抗原的阳性或者是e抗原的阴性，阳性者俗称为大三阳阴性者称是小三阳。其实它只是血清学在检测过程中出现的一些免疫指标的变化，并不能代表病情的轻重或者传染性的大小病情的轻重，主要看肝功能的各项指标以及肝脏影像学以及病理学的一些指标传染性的大小，主要看血液中乙肝病毒的载量。
大三阳是：乙肝表面抗原、乙肝E抗原、乙肝核心抗体阳性。称为大三阳。小三阳是：乙肝表面抗原、乙肝E抗体、乙肝核心抗体阳性。称为小三阳。大三阳的传染性强，小三阳的传染性弱。大三阳也是会发展为小三阳的，但是未必都是转变为好的意思，所以需要综合其它临床的检查结果来分析病情，生活上注意戒烟戒酒，饮食清淡，以蔬菜水果为主，少吃辛辣食。
乙肝大三阳和小三阳的区别在于大三阳是e抗原阳性，小三阳是e抗原阴性。
乙肝大三阳指乙肝患者体内乙肝病毒的免疫指标即乙肝表面抗原、乙肝e抗原、乙肝核心抗体这三项为阳性，指标可提示患者体内病毒的复制是否比较活跃，但却法知晓该细胞是否受到严重损害。患者在去医院进行检测时，如果表面抗原乙肝e抗原和核心抗体的检测都是阳性，也就是乙肝五项检测中135呈阳性，则是大三阳。如果乙肝五项检测中，145都是阳性，我们则可以称其为小三阳。大三阳体内的乙肝病毒会呈现较活跃的复制状态传染性也是比较长，小三阳的肝功能长期较正常，称为稳定性的小三阳，传染性较低。肝功能检查时发现反复异常，则为不稳定性的小三阳，传染性较强。
乙肝大三阳和小三阳都是针对乙肝五项来说的，乙肝五项包括乙肝表面抗原、乙肝表面抗体、乙肝e抗原、乙肝e抗体和乙肝核心抗体五项。大三阳是指以上顺序中的第135项阳性，小三阳指第145项是阳性的。常规的大三阳提示病毒复制活跃，而小三阳提示乙肝病毒处于相对稳定的状态，但是并不能一概而论，有的乙肝五项呈现的小三阳。
在乙肝两对半化验单中，乙肝小三阳是145阳性，乙肝大三阳是135阳性。乙肝大三阳提示乙肝病毒数量多，病毒复制活跃，传染性大。乙肝小三阳提示乙肝病毒数量相对较少，病毒复制活跃称程度低，传染性小。所以乙肝大三阳比乙肝小三阳要严重些。但是针对乙肝大三阳患者也不要担心，目前有恩替卡韦、替诺福韦酯等抗病毒药物，90%能使大三阳转变为小三阳的。