少数人可能出现发热，不适，寒战，出汗，肌痛，关节疼痛恶心，呕吐，腹痛，腹泻等不良反应.以上反应，通常在1-2天内自行消失，一般不需特殊处理，如果体温太高，就得给孩子口服退烧药物观察看看，如果持续高烧不退就得到医院做个相关检查，查下血常规，明确病因再对症治疗。先别给孩子吃鸡蛋鱼类的食物。多喝水，避免剧烈运动。
如果小儿处在发热等身体欠佳的状态下，暂时不要接种这种疫苗。等身体完全康复后才可以接种这种疫苗，一定要在接种后注意观察，出现什么状况，有时候还会发出现发热的情况。
全身不良反应:常见发热、疲劳乏力、头痛、头晕、恶心;偶见咽喉疼痛、肌肉疼痛、咳嗽、腹痛、关节疼痛、活动异常(活动减少/增多)口干、食欲不振、腹泻、过敏、胸闷。三岁以下的孩子不能打甲流疫苗。
以下人员不适合接种甲流疫苗：对鸡蛋或疫苗中任何其他成分（包括辅料、相关药物、裂解液等），特别是卵清蛋白过敏者；患急性疾病、严重慢性疾病、慢性疾病的急性发病期、感冒和发热者；格林巴利综合症病人；未控制的癫痫和患其他进行性神经系统疾病者；严重过敏体质者，对相关药物过敏者；年龄小于3岁者。以上6个人群，医生认为不适合接种甲流疫苗。
流感疫苗接种后，出现咽喉疼痛症状，与疫苗没有明显的关系，由于人体感染了病毒，很容易出现咽喉疼痛。会出现严重的温升情况，吃抗病毒药物可以用来治疗疾病，平时要注意观察咳嗽和痰的症状。
打甲肝疫苗是为了预防感染甲型肝炎病毒在人体有感冒发烧出现过敏，或者是有疱疹，麻疹风疹等情况下是不可以打甲型肝炎病毒疫苗的，如果打可能会加重病情，引起病毒感染，平时要注意身体，感冒发烧的情况下是不可以打疫苗。
