是由于尿液中溶解着人体代谢所产生的代谢产物，即尿液是一种溶液，如果存在溶液浓度过高、泌尿道上皮欠光滑、尿流不通畅、泌尿道中有异物等因素存在，浓度过高的溶液中的溶质就会形成结晶而析出，时间长了会慢慢长大，并且有钙盐沉着，从而形成结石。
输尿管是尿液流动的通道，肾脏产生的尿液经过肾盂汇集后，通过输尿管向下运输到膀胱，进而借助尿道排出体外。当输尿管内出现结石时，尿液运输流动会受到影响，肾脏产生的尿液在结石近侧聚集，引起肾脏积水、扩张。严重者可压迫肾脏实质，使肾实质厚度变薄、肾单位功能受损，最终影响到患侧肾功能。可通过手术治疗。
常见原因是泌尿系统疾病，大部分原因主要是由于泌尿系统疾病引起的，如肾小球疾病、间质性肾炎、尿路感染、泌尿系结石、泌尿系肿瘤、多囊肾等。还有全身性疾病，如感染性疾病、血液性疾病、自身免疫性疾病、心血管疾病。由尿路邻近器官的疾病造成的，如前列腺炎盆腔炎、宫颈炎、结直肠炎。
血尿多半是由于泌尿系本身疾病所致，其中以肾小球疾病，肾囊肿、结石前列腺增生、尿路感染性疾病及肿瘤最为多见。其他如凝血异常，血小板减少、血友病、坏血病，全身性疾病也可引起血尿。
血尿的原因有很多种，主要为各种肾小球的疾病引起的肾小球源性的血尿。还有泌尿系统的疾病，如结石、肿瘤、泌尿系感染、血管损伤或先天畸形等。全身性的疾病，例如血液系统的疾病、感染性的疾病和风湿免疫性的疾病，都可导致血尿的发生。