如果是比较小的囊肿，直径在4cm以下的对肾脏实质并不造成压迫，平时也没有明显临床症状的可以动态观察，不用处理。如果囊肿的直径超过了5cm以上，伴随有腰部酸胀症状，需要通过穿刺或者手术治疗。如果囊肿直径在6cm以上，不论是否有症状都建议做手术治疗。
肾脏的囊肿是一种良性的病变，囊肿可以引起肾脏皮质的破坏，影响肾脏功能，需要结合囊肿的大小，肾脏功能状况确定是否治疗，可以做个肾脏彩超看一下囊肿的大小，如果囊肿不大，对肾脏功能影响非常小，可以不处理，定期复查就可以。
无自觉症状，也不需特殊治疗，况且药物保守治疗效果不明显。可以定期复查，如果囊肿增大较快或有性质改变，可以考虑手术治疗。囊肿不是实质性恶性肿瘤，也不是肾脏的器质性疾病，囊肿较小对肾功能及身体其他方面没有不良影响。
小的囊肿暂时不需要治疗的，随访观察就行了，超过5厘米大的囊肿可以手术治疗，一般选择微创手术封闭治疗，效果还是很好的，不过有复发的现象的。平时规律生活，少吃辛辣刺激的食物，适量运动，定期复查。
肾囊肿初期没有任何的临床症状，随着囊肿的不断增大，就会表现出一系列的临床症状。如果囊肿较大压迫到肾包膜会引起肾脏酸胀，疼痛等症状，肾囊肿压迫到肾盂输尿管容易造成肾积水，影响到肾功能。