在睾丸本身发育不良时，对于促性腺激素的反应就会缺乏敏感度，进而产生隐睾的情况。隐睾是会遗传的，如果直系血亲中也发生过隐睾，其家族后辈中就很容易也出现隐睾的情况。在男性还是胎儿的时期，如果睾丸系带比较短，就会使睾丸的下降不完全，这就会导致隐睾。
随着胎儿的生长发育，睾丸自腹膜后腰部开始下降，于胎儿后期降入阴囊，如果在下降过程中受到阻碍，就会形成隐睾对身体健康的影响表现在两个方面：其一，隐睾会影响睾丸的生长发育从而导致生精功能障碍。
隐睾症是由异常睾丸下降引起的。导致睾丸异常下降的因素很多。常见的是睾丸导带异常或缺失，导致睾丸进入阴囊，使睾丸不能从原来的位置下降到阴囊。先天性睾丸发育不良使睾丸对促性腺激素不敏感，失去下降动力。
如果隐睾比较严重的病人，可能会引起不孕不育的疾病。也有可能那会引起，早泄。阳痿。或者慢性前列腺炎。还有尿道炎，或者尿路感染的这些疾病，所以需要尽早的干预治疗，以防引起其他病变。
胎儿胚胎发育初期，睾丸通过中肾管形成并位于腹膜后方，然后通过其本身分泌激素和下丘脑垂体产生激素，并受睾丸引带牵拉，慢慢地从腹膜后方，通过腹股沟降到阴囊内。
若下降时，由于某些因素的作用，使睾丸滞留于下降时的某个位置而不再持续下降时，则形成阴睾。隐睾婴儿出生时阴囊内将无睾丸，新生儿正常值约为3个月时，部分患儿睾丸仍可持续减少，1岁时不易减少，此时发生率约为3岁，需手术。
隐睾位置的不同，隐睾发生恶变临床表现也不同。常表现为隐睾区逐渐增大的质硬包块，常不伴有疼痛。如腹股沟区或阴囊内的肿块，阴囊坠胀不适等。腹腔内的隐睾发生恶变，可表现为腹部包块，腹痛、腹胀等不适。