主要是看尿分叉是由什么原因引起的。如果仅仅是因为早上第一次排尿出现的尿分叉，这属于正常现象，不用治疗。如果曾经有过淋菌性尿道炎而引起的尿分叉，需要做的是尿道扩张。如果是包皮过长，或者包茎引起的，行手术治疗。如果是前列腺肥大增生引起的，口服药物治疗。
尿分叉在临床上，有两种情况，一种是生理性的要分叉，不要担心，这不属于疾病，比如性生活刚结束，尿道里面有少量精液，这时候出现尿分叉属于正常的。还有一种尿分叉属于病理性的，比如肾结石，输卵管结石，尿结石，尿道里面发生了堵塞，小便的时候出现尿分叉，前列腺炎，出现了梦遗，尿液浑浊，失眠多梦，小便分叉，就需要进行药物治疗。
尿分叉可分为生理性和病理性，生理性尿分叉是由于尿道开口处临时阻塞尿道口，病理性尿分叉是由于尿道有炎症，比如慢性前列腺炎，尿道炎，尿道结石等，治疗主要是治疗原发病，针对导致尿道分叉的原因对症治疗。
尿分叉流脓是泌尿系统感染，一般多见于淋病和非淋菌性尿道炎。应该立即到医院做尿常规，支原体，衣原体和淋球菌的检查。暂时不要性生活，以免传染，平时要多注意卫生，同时不要乱服用药物。
如果只是尿分叉，没有排尿不畅、血尿等其他不适，可以使用药物来进行治疗，还应该行为干预治疗，包括禁食辛辣食物及戒酒。忌久坐，要适当运动。同时要注意性生活次数，要规律性生活，每周一次。
尿分叉尿不尽可以通过药物治疗、手术治疗等方式进行改善。
尿分叉尿不畅，主要是因为前列腺增生症，前列腺增生症是一种常见的疾病，主要是因为腺体的生长对尿路的挤压，导致尿路狭窄，导致尿路变窄，导致尿分叉尿不畅，尿频尿急等一系列的表现。常用的治疗方法有：药物治疗和外科手术。在平时，患者也需要注意饮食，避免吃辛辣的食物。