疱疹性咽峡炎后期会咳嗽，咳嗽是人体清除呼吸道内的分泌物或异物的保护性呼吸反射动作一般由感冒引起。得了疱疹性咽峡炎不会有咳嗽反应。虽然感冒与疱疹性咽峡炎均属于急性上呼吸道感染但疱疹性咽峡炎的病灶主要在于咽、软腭、悬雍垂(口腔中软腭后缘正中悬垂的小圆锥体。
疱疹性的咽峡炎会出现咳嗽，但是此时的咳嗽往往是刺激性的干咳，不太严重，也不会太深。出现疱疹性咽峡炎的时候，咽喉部会有疱疹，所以会刺激咽喉部出现咳嗽。另外，咽喉部还会有充血和水肿，还会有少量的炎性渗出物，也会刺激咽喉部以及气管出现咳嗽。
可以使用抗病毒药物治疗，疱疹性咽峡炎是由于疱疹病毒感染引起的咽峡部炎症，是具有传染性的，所以首先要做好消毒隔离，避免到人多的公共场所。同时饮食上增强营养，多吃一些鸡蛋，鱼虾，瘦肉等富含蛋白的食物。
疱疹性咽峡炎是可以口服奥司他韦治疗的，疱疹性咽峡炎是病毒感染，常见于儿童，会导致高热，咽喉部疼痛，肌肉酸痛的症状，会因为咽喉部剧痛而出现拒食，容易引起水电解质紊乱，多喝水多注意休息，清淡饮食，大约10天左右就可以好转。
可能是发生后体内缺水引起的刺激性咳嗽，疱疹性的咽峡炎也会出现咳嗽，只是咳嗽的症状并不是很严重，可以口服消炎药来治疗，如果出现白细胞的升高，说明合并细菌性的感染。
疱疹性咽峡炎是由于病毒感染引起的一种急性上呼吸道感染，主要发生于夏、秋季，症状可以表现为高热、咽痛、流口水、厌食、呕吐等。在孩子咽部可以发现明显的充血，在口腔的颊黏膜、上腭等地方可以看到有灰白色的小疱疹，周围有红晕，疱疹1-2天后破溃可以形成小溃疡。