肾病综合症的治疗通常分为对症治疗和针对肾脏病理本身治疗两部分。对症治疗，主要包括限制水的摄入，低盐低脂饮食，可以使用降压药物缓解水肿，控制血压。针对肾脏病理的治疗，又包括使用激素和不使用激素两种情况。大部分病人需要使用糖皮质激素，甚至需要联合使用免疫抑制剂治疗。
首先要控制好血糖，这种肾病继续进一步发展，减缓发展速度，同时要控制好血压，因为糖尿病，有一半以上的都会同时合并有高血压，对于浮肿非常明显，高度浮肿出现胸腹腔积液，甚至引起胸闷气短的心衰，可以考虑使用利尿剂消肿，如果利尿药物效果不好，也可以考虑临时进行透析，超滤脱水减轻心脏负担。
糖尿病引起的肾病综合征需要针对原发病进行治疗，糖尿病引起的肾病综合征，要积极调控血糖，同时采用降尿蛋白、调脂、抗聚等对症治疗。同时需要注意控制糖份和蛋白的摄入，要注意饮食清淡。
小儿肾病综合征主要是应用具有补脾益肾、消肿利尿的中药药物进行治疗。
常用的中草药包括车前子、白芍、附子、白术、茯苓、泽泻、黄芪以及薏苡仁等。比较常用的中成药包括六味地黄丸或者肾气丸等。应用上述药物帮助肾病综合征患儿改善低蛋白血症、高蛋白尿以及水肿等不适症状。但用药应谨遵医嘱，不能擅自用药，以免引起身体不适。
糖皮质激素类药物治疗：减轻组织修复所致的纤维化，可以降低基底膜通透性，改善水肿，症状改善后逐渐减量。免疫治疗：CTA是一种有效的细胞免疫抑制剂，可以很好的治疗疾病。