血源性肺脓肿是由于皮肤受到外伤感染或痈疖感染，而引起的内毒血症。脓毒血症栓会通过血液传播至肺部，使两肺出现炎症、坏死以及脓腔。血源性肺脓肿大多是金黄色葡萄球菌，合并成脓毒血症，因此治疗应选择抗菌治疗。在选择敏感的抗生素治疗时，应留取痰液，血液作为标本培养，以此进行抗生素的治疗。在当前治疗血源性肺脓肿，选择抗生素通常效果会比较。
血源性肺脓肿可以采用头孢二代、头孢三代等抗感染药，并保留痰液样本。可以根据患者的痰样本进行药敏检测，选择使用抗生素，但也有少数的金黄色葡萄球菌对青霉素具有抗药性，可以使用万古霉素、利奈唑胺、利福平等，经验性使用二代、三代的头孢，并使用抗厌氧菌，如甲硝唑、克林霉素、林可霉素等。另外还需要做好痰的引流工作，痰液的排出对病情的恢复有很大的帮助。
血源性肺脓肿最常见的病原菌是革兰氏阳性球菌，这种病菌会造成肺多发小脓肿，其中又以金黄色葡萄球菌更为严重，患者一旦确诊血源性肺脓肿，必须要及时明确病原菌，才能更好的做到对症治疗。明确病原菌可以通过抽血培养的方式，在患者还没有使用抗生素之前，抽取血培判断是哪一种致病菌。血源性肺脓肿多发于青壮年，男性的发病比例要高于女性。
肺脓肿得治疗15天到20天。具体时间也需要结合病情的轻重程度以及个人的体质决定。出现肺脓肿之后，在早期要在医生指导下及时选择抗感染的方式进行改善，通常病程的时间很短，大概20天左右能够治愈。如果患者没有及时治疗，可能导致病情越来越严重，因此需要选择抗生素类的药物进行改善，整个病情可能会超过20天。也可能会成为慢性肺囊肿。
治疗肺脓肿的药物主要有青霉素类药物和大环内酯类药物。肺脓肿确诊后要及时进行治疗，首先要用抗生素进行积极的治疗，抗生素要覆盖厌氧菌，比如青霉素、甲硝唑、奥硝唑、克林霉素、林可霉素等，另外还要加强痰培养的检查，可以根据药敏试验更换抗生素。其次要重视痰液的引流，主要有体位引流和化痰的药物，氨溴索、桉柠檬碱、乙酰半胱氨酸等。如果出现高热症状，可以口服一些解热止痛的药物，比如美林、洛索洛芬钠、阿司匹林等。如果病人有休克症状，应进行静脉输液，并应用血管活性药物。