一般情况下，指甲盖凹凸不平有小坑可能是真菌感染、营养不良等原因导致的。
1.真菌感染：创伤后可能会导致指甲被真菌感染，造成甲癣，此时可能会出现指甲异常生长的情况，导致指甲盖凹凸不平有小坑。
2.营养不良：如果缺乏营养，可能会导致甲营养不良，造成指甲生长比较慢，导致指甲盖凹凸不平有小坑，平时要适当补充营养，多休息。
孩子指甲凹凸不平，常见的原因主要包括长期的缺乏营养，贫血或者是体内缺乏辛硫蛋白质等微量元素，可以做微量元素检测，可以明确。指甲凹凸不平，还有可能是灰指甲，因为真菌感染可以破坏甲床。
手指甲盖凹凸不平常见由甲癣、缺乏维生素A等因素引起。
1、甲癣：手部卫生条件差就可能患有甲癣，该疾病容易导致病甲出现变形、浑浊、增厚、分离、变色等情况，所以可能表现为手指甲盖凹凸不平，可遵医嘱使用环吡酮胺乳膏、盐酸特比萘芬溶液等药物治疗。
2、缺乏维生素A：患者存在长期挑食的情况导致体内缺乏维生素A，便容易使得角质化减弱，导致指甲出现变软、变薄、易断裂、变形等症状，因此缺乏维生素A也可能造成手指甲盖凹凸不平，通常可适当多吃胡萝卜、菠菜、鸡蛋等富含维生素A的食物进行改善。
提示身体可能缺乏蛋白质，微量元素缺乏，多与挑食、偏食有关，这是饮食不规律均衡等原因引起，想要治疗的情况下可通过改善日常的膳食并每天补充多种维生素，另外配合服用维生素B621金维他即可。
指甲凹凸不平，表现为指甲上一个一个的小凹坑，一般会波及到一个或者多个指甲，它是皮肤病的一种，即甲营养不良，与身体缺乏维生素B有关。这种甲营养不良对人体无害，只是不好看。而吃些多种维生素片可以帮助消除。
一般情况下，大脚指甲凹凸不平可能是缺乏微量元素、真菌感染等因素造成的，具体内容如下：
1.缺乏微量元素：如果患者挑食、节食，可能会导致体内缺乏微量元素，可能会影响指甲生长，可能出现大脚指甲凹凸不平的情况。患者可以遵医嘱使用葡萄糖酸钙口服溶液等药物进行治疗。
2.真菌感染：如果患者不注意个人卫生，可能会感染真菌，可能诱发甲癣，可能导致大脚指甲凹凸不平。患者可以遵医嘱使用复方氨维胶囊、盐酸特比萘芬软膏等药物进行治疗。