一般情况下，龟头沟槽里长肉刺的原因较多，患者需要对症治疗，具体内容如下：
龟头沟槽里长肉刺可能是阴茎珍珠疹造成的，多见于冠状沟，特别是系带，如海藻样，质地柔软，没有红肿、疼痛等不适，且体积不会有太大的变化。如果是包皮过长、包茎等原因，不需要特别的处理。龟头沟槽里长肉刺还可能是尖锐湿疣造成的，最初是一种肉刺样的变化，随着体积的增长，呈乳头状或菜花状，表面有分泌物，并伴有难闻的气味，随着时间的推移，其体积会越来越大，融合的次数也会越来越多。
一般来说，龟头有肉刺可以采取如下手段治疗：
使用高锰酸钾液清洗局部并注意保持局部清洁和干燥的状态。药物治疗，激光治疗，冷冻治疗，电烧治疗，微波治疗等方式也可以治疗龟头有肉刺的症状。患者在日常生活中，应该调整饮食结构，忌生冷辛辣的食物，多吃新鲜的水果蔬菜，保证足量摄入身体所需要的营养。
此外，患者平时应该适当运动，比如慢跑、游泳等，早睡早起，注意多休息，有利于身体健康。
龟头上长肉刺，多考虑为阴茎珍珠疹，常常位于龟头冠状沟部位，不痛不痒，没有任何症状，不是病毒和细菌感染引起，不属于性病及感染。常见于包皮过长的患者，龟头长期被包裹，尿液及潮湿形成慢性刺激，无需任何治疗，也没有任何传染性，定时清洗包皮，保持包皮干燥。如条件许可，需行包皮环切手术，减少刺激因素后即可治愈。
包皮上的肉棘可能是由局部息肉、扁平疣和病毒感染引起的常见疣等因素造成的，应及时到医院皮肤科进一步检查。如果以前有过不洁的性行为，也应该考虑是否是传染病和传播疾病。如果激光或液氮冷冻疗法可以在局部使用，应该放松并有正确的理解。
有可能是属于微循环不良引起的痔疮，是属于外痔的一种表现，可以直接去院外科采取手术治疗，如果是由于局部的息肉性改变，可以采取激光等物理治疗措施，平时应该保持大便通畅，不吃刺激性较大的食物。
龟头上长有小肉刺可能为包皮龟头炎，包皮龟头炎是由于包皮过长引起的，由于包皮过长。如果较轻，可以经常用清水清洗；如果较重议外用溶液清洗，口服消炎类药物.平时禁忌辛辣和刺激性食物，戒烟酒，每天清洗外生殖器，性生活前后也要注意清洗。