通常情况下，药物流产危害可能是出现流产不全。具体情况分析如下：
药物流产是指使用米非司酮片、米索前列醇片等药物终止早期妊娠，在停经49天之内，患者一般可以按照医嘱使用米非司酮片使体内的孕酮下降，进而引起流产，再通过使用米索前列醇片使子宫剧烈收缩，使胚胎排出体外，当胎儿较大时，如果进行药物流产可能会出现流产不全的情况。
药物流产对女性的生殖健康有一定的不良影响，如胃肠道反应，大出血等。除了恶心，呕吐，腹泻，腹痛等胃肠道反应外，药流不全，大出血或者阴道流血时间长是它主要的副作用。万一发生大出血，需要紧急清宫止血治疗，否则有失血性休克的可能性。所以药物流产需要在具有抢救条件医院的医生的指导下服用，服药的过程中注意阴道流血情况，以及妊娠囊排出的情况。如果药流后1个月内有同房，会造成一些妇科的炎症的疾病。出现妇科炎症会影响以后的生育，可能导致以后的不孕不育。在流产后的10-15天一定要返回医院做彩超检查排除宫腔内有没有药物流产后的残留。如果药物流产以后出血多，腹痛加重，要及时的返回医院看急诊。
药物流产的副作用最小的也容易引起月经失调，表现为月经周期缩短或延长，月经量增多，而对于未生育的来说，如果反复使用，不仅容易引起感染或大出血，还会导致不孕，造成终身遗憾。
药流在怀孕49天之内可以进行药流。药流相对人工流产来说，会对子宫的伤害性小一些，会有腹痛的症状，缺点就是容易导致流产不干净不彻底，还需要进一步进行清宫手术。清宫手术对子宫伤害性比较大。
药物流产可能出现的危害有：在进行流产的过程中有可能出现流产不全，胎盘、胎膜残留的情况；药物流产可以引起流血时间长，出血多，引起贫血；还可能出现子宫内膜异位症；药物流产可以引起流产不全，需要再次清宫，增加感染机会，感染容易引发不孕症。