一般情况下，药物流产后流不干净，做清宫手术是会疼的，属于正常的反应。
清宫手术的疼痛感主要是清宫时扩张宫腔带来的，在医疗器械进入宫腔内的刮宫过程也会疼痛，因此药物流产后流不干净，做清宫手术是会疼的。在采用无痛的清宫手术后，麻药药效过后，也会有轻微的疼痛感，但是一般在可以承受的范围内。
日常生活中女性要注意多休息，坚持清淡饮食，不要吃辛辣、刺激的食物，有利于病情的恢复。
流产，清宫的时候是有疼痛的，但是流产后清宫这种疼痛都能忍受，一般术后一个月去医院复查，平时营养健康饮食，不要着凉，吃新鲜蔬菜和水果，补充维生素，忌食辛辣刺激性食物。
药物流产后出现肚子痛是正常的，因为孕囊排出后子宫会收缩，使子宫恢复到孕前状态。肚子疼可以通过吃一些促进子宫收缩的药物来促进宫腔内淤血排出，比如益母草颗粒、新生化颗粒等；还可以通常适当的腹部理疗，如腹部按摩理疗、热水袋热敷等方式缓解症状。必要时还可以喝红糖水，可以缓解疼痛，补充能量，促进术后患者身体的恢复。
通常来说，药物流产后肚子可能不会很疼，也可能会，具体情况因人而异。
药物流产的优点就是方法简单、疼痛感轻，不需要进行宫腔内操作，所以大多数情况下药物流产后肚子可能不会很疼。但因为药物流产的药物是空腹服用的，如果对胃肠道的刺激性比较明显，药物流产后肚子可能会有剧烈的疼痛，同时如果药物流产后出现感染，也可能会出现肚子疼的情况，建议注意复查妇科彩超。
通常来说，药物流产后肚子会疼一周左右。
药物流产后，随着孕囊排出体外，肚子疼、阴道流血等症状通常会有所缓解，但如果患者自身对米索前列醇反应较大，药效持续时间长，肚子疼的症状可能会因宫缩而延长疼痛时间，但一般不超过一周的时间。如果腹痛剧烈难以耐受，且在排出孕囊后出血仍多，建议到医院做相关检查，可能存在感染的情况。
药物流产后腰疼的厉害可能是子宫收缩牵拉腰部导致的，具体分析如下：
药物流产是一种促进子宫收缩的方法，可以帮助流产。因为子宫收缩会牵扯到腰部，导致腰酸胀，是子宫复旧的一种情况。药物流经后要保持仰卧，多休息。不能久坐，可以通过热敷腰部来减轻疼痛，还可以进行按摩。一周后仍不见好转，可以到医院做检查，看看是否有腰肌劳损。千万别做剧烈的锻炼。术后要注意保暖。