男性衣原体感染可能是直接接触、免疫力低下等原因造成的。
衣原体可以通过一个细小的破洞进入人体，它会在几天后潜藏起来，直到细菌数量达到一定程度才会发作。另外，也可能是因为病人本身的免疫功能比较差。这种情况是指不是通过性传播，如果患者暴露在衣原体感染病人身上，或者是被污染了的器具上，比如说，带着分泌物的浴巾、脚布、脚盆、马桶等。这也是最普遍的原因，因为它是由非性传播的。
衣原体感染可能是性传播、分娩等原因造成的。
衣原体是由于感染细菌而引起的，最常见的感染途径是通过性传播造成感染。还可能是在分娩过程中，传染给孩子，导致新生儿出现肺炎或者严重的眼部感染。并且长期生活在卫生条件不合格的环境中，都可能导致健康人群感染支原体。
妇科衣原体感染通常是性接触或间接扩散等。
性接触可传播妇科衣原体，不洁性生活和性生活接触者混乱，极易染病，因此，性生活时必须采取防护措施，以免染上某些病，同时，应尽量避免不洁净性生活。间接扩散还可感染妇科衣原体，大部分是因为与染病毛巾、马桶和衣物接触。因此，应重视个人卫生护理，减少公共物品的利用，重视消毒的应用。
女性衣原体感染可能是性行为不洁、直接接触等方式造成的。
衣原体是由不同的因素引起的，首先是最普遍的，就是性交，这个是最普遍存在的，只要是有性生活的人，都会受到衣原体的影响，这个是最普遍的一种，可以传染给各个年龄层。另外，还可以通过直接接触造成感染，女性可能会发生宫外孕、流产、不孕、甚至是婴儿的死亡，以及由沙眼衣原体引起的泌尿系统感染，如果是被传染，则会有大量的宫颈充血水肿，或者是粘液脓性的分泌物宫颈充血水肿。
支原体感染是指肺炎支原体感染支气管引起的病变。肺炎支原体是一种介于病毒和细菌的病原体。经常引起呼吸道感染，引起支气管炎、肺炎的发生。而且支原体感染的表现多样，有可能引起心肌炎、关节炎、肺炎、低热等表现。常用的药物有大环内酯类药物，用药一般在两周左右，可以复查支原体抗体。
男性衣原体阳性说明感染了支原体。
如果是男性，通常是尿道衣原体的感染，30%-50%的非淋细菌性尿道炎是由衣原体所致，患者在非淋菌性尿道炎的时候，会有尿道瘙痒、尿道不适、尿道外口稀疏的分泌物。
一般情况下，可以用药物进行分泌液培养，一般情况下可以用盐酸多西环素、盐酸米诺环素、罗红霉素、甲砜霉素等药物进行连续的药物处理，大部分患者的症状都会得到改善。