一般男性可以在男科，女性可以在妇科做性功能检查。
男性或者是泌尿外科都需要做一些性功能的检测。通过海绵体活检、血管活性药物注入、彩色双功能超声波及海绵体血管造影、海绵体内测血压等辅助检测，以确定其器官病变的原因。此外，检测男性的阴茎生理阈值、球海绵体的反射潜伏期、神经传导速率检测等也有助于诊断血管和神经系统的原因。
一般性功能检查男科、泌尿外科、生殖健康医学科等科室可以做。
男科、泌尿外科、生殖健康医学科等科室对性功能进行检查，排除了器质性疾病，可以通过简单的药物和外科的方法来进行恢复。如前列腺炎、阴茎海绵体动脉硬化、阴茎海绵体供血不足、阴茎海绵体动脉静脉瘘等，都要做手术。
性功能在男科进行检查。
医生会询问性功能异常的发作形式、严重程度等因素，以及性生活的姿势对性功能的影响，以及性欲的变化；还会询问患者是否可以口服一些影响性功能的药，如降压药、抗高血压药、抗抑郁药、激素类药物，有没有吸烟、酗酒史等，还要做一些身体检查，了解外生殖器有没有异常。
进行肛门检查，首先应当选择合适的体位，可选择膝胸位、截石位、弯腰俯卧位，有时也可以采取左侧卧位，选择合适的体位，对检查疾病有很大的帮助。首先应当进行肛门视诊，观察肛门的位置是否有异位变形等。然后观察肛门周围的皮肤及颜色，是否存在着红斑、糜烂、渗出，是否有肿物。
性功能检查可以挂男科或者泌尿外科。
性功能检测包括男性勃起功能检测，也可进行视听性刺激勃起检测、视听性刺检测等。男性在进行性功能检测的同时也可进行阴茎海绵体造影，通过阴茎海绵体造影能够对是否存在阴茎海绵体动静脉瘘，以及是否存在阴茎动脉供血狭窄进行客观的评估。
