一般的治疗方法，对于没有症状或者是亚临床的感染，无需药物治疗。有症状者治疗包括全身治疗和局部处理两个方面。全身治疗主要包括抗病毒治疗和治疗合并感染，选择局部的处理方法和全身治疗的方案。此外，由于生殖器疱疹尚无彻底的办法，这常给病人带来很大的心理压力。因此，针对实际情况，同时给予医学的咨询和心理咨询，以减轻精神负担。
生殖器疱疹是一种由于单纯疱疹病毒导致引起的一种性传播疾病，这个疾病容易反复发作。对于生殖器疱疹来说，一般要采用抗病毒的治疗比如阿昔洛韦，但是初发跟复发的治疗疗程剂量也是不一样的。对于生殖器疱疹，一定要保持心态良好，对治疗要积极配合，保持日常卫生从而防止传播，早日康复。
妊娠合并生殖器疱疹的治疗方法一般有局部用药、全身用药等，具体内容如下：
1.通过局部用药可以保护疱疹的粘膜，使用生理盐水清洗阴道，使其干净、乾净。用甲紫溶液或阿昔洛韦乳膏或乳霜涂抹于病变部位，或使用酞丁安软膏。如果有明显的痛楚，可以在局部应用盐酸利多卡因软膏或口服镇痛药物，也可以将奥平的栓剂放入阴道。
2.全身用药一般建议口服阿昔韦，反复发作者应长期口服。怀孕期间要按照医生的指示服用。阿昔洛韦治出现任何其它不良反应，通常只是暂时降低嗜血因子引起的。
治疗生殖器疱疹中医中药的话，是抗病毒处理治疗。早发现早点去处理，另外一个就是如果有脓性分泌物的话，这个还是去医院检查一下其他性病方面的种类的。因为主要这个疾病是因为感染生殖器疱疹病毒，然后引起来的，可以口服或者是外用一些抗病毒的药物处理这两者。
及时地到医院进行就诊。采取药物结合理疗的方式进行治疗，同时注意局部的卫生。建议治疗期间不要有性生活，以免交叉感染。阻断生殖器疱疹病毒DNA的复制，就像给人结扎了一样，使其不能产生新的病毒，从而彻底清除生殖器疱疹病毒。
生殖器疱疹是很容易复发的疾病，但如果治疗的病毒不会得到复制，疾病是可以得到治愈的。生殖器疱疹是由人类单纯疱疹病毒感染人的生殖器和生殖器部位所引起的常见的性传播疾病，表现为水疱、糜烂或溃疡具有疼痛，传染性比较强的。