一般来说，碘伏和高锰酸钾因为其主要成份和作用都不一样，没有太大的区别。
碘伏的主要成份是活性碘，它是一种杀菌、杀菌的药剂，不刺激皮肤和粘膜，可以对皮肤、伤口、会阴处进行杀菌，因此它的应用范围很广，对病菌、霉菌、孢子等都有很好的杀菌效果。而高锰酸钾是一种很强的氧化剂，主要用于会阴、肛门等部位的消毒。
通常来讲，高锰酸钾和碘伏相比较，碘伏会比较好。
如果高锰酸钾和碘伏做选择，那么碘伏的效果就会更好。因为碘伏是一种外科常用的消毒剂，具有很好的杀菌和消毒的作用，并且对伤口的局部刺激也是最小的，是一种比较温和的消毒剂。痔疮术后常用的是高锰酸钾溶液，平时可以用高锰酸钾溶液来清洗肛门，促进痔疮术后的愈合。因此，碘伏消毒水的作用更大。
高锰酸钾并不是碘伏。
高锰酸钾和碘伏不一样，虽然两者都有杀菌消炎的作用，但本质上还是有区别的。高锰酸钾属于强氧化剂，需要在稀释后使用，主要用于坐浴或局部粘膜消毒。而碘伏属于消毒剂，没有强的刺激性，擦拭伤口时不会有明显的刺痛感，而且会形成一层保护膜，不仅有消毒作用，还有保护创面的作用，临床上可用于外伤消毒，输液时的皮肤消毒。
碘伏和高锰酸钾都有杀菌的功效，但两者并不相同。碘伏是消毒剂，它是一种结合物，刺激性小，安全性高，擦拭在伤口处几乎无痛感。高锰酸钾是一种无机化合物，也是一种强氧化剂，也叫锰酸钾，有很强的氧化性，对皮肤有较强的刺激性和腐蚀性。
一般来讲治疗包皮龟头炎建议每天至少早晚两次泡洗,每次泡洗3-5分钟比较适合,如果时间允许,建议每天增加泡洗次数,比如说每天泡洗3-4次,能够更有效的去除包皮龟头炎。不能够浸泡时间过长，因为高锰酸钾溶液有一定的腐蚀性，时间长了以后会导致龟头皮肤损伤，引起化学性的炎症感染的表现，反而会加重病情的。平时少吃辛辣刺激的食物，忌烟酒，保持充足的睡眠，少熬夜。
高锰酸钾一般情况下最多连续用7天左右。
正常来说，高锰酸钾具有良好的清除皮肤细菌的效果，对于隐私部位的细菌清理有很好的效果。但是高锰酸钾对皮肤有刺激性作用，如果患者长期使用或者用量过大，有可能会导致皮肤瘙痒、脱皮等病症，不建议患者长期使用。患者在使用高锰酸钾后，产生的效果不明显，或者身体出现异样，应及时停止使用。