淋菌性附睾炎的发生一般是淋球菌逆行感染所致，大多因淋球菌引起的尿道炎、前列腺及精索逆行发展而来，淋菌性附睾炎及睾丸炎常发生于急性淋菌性尿道炎之后，单侧居多。该并发症发病较急。初起时阴囊和睾丸牵拉痛，进行性加重，并向腹股沟放射，有低热。严重者可有高热，体温39～40℃，阴囊皮肤潮红、灼热。
一般情况下，附睾炎主要症状表现为：
1.阴囊肿大、疼痛，特别是在急性期会有明显的表现。特别是当运动时，当阴囊的内容物随着运动而晃动时，会产生剧烈的疼痛，使人不能用手指去碰触，而且会引起腹股沟区的疼痛，甚至会引起同侧背痛。
2.附睾和睾丸增大，最初的附睾肿胀，与睾丸无边界的粘合。当炎症逐渐被消化后，可以触及到睾丸和附睾的边界，但是随着炎症的加剧，会影响到睾丸，引起睾丸的痛苦和肿大。
3.附睾结节，随着炎症的逐渐消退，其形成的瘢痕会在附睾中形成。如果用手指去摸，会发现有疼痛或者不疼痛的小结节，这种小的东西很坚硬，会影响到输精管的畅通，从而引起不孕。
附睾炎是由细菌感染造成的，比如大肠杆菌，这些致病菌导致附睾部位发炎。如果急性发作，可能会出现高热寒战，抽血坚检查可以明显看出白细胞数增高。感染还会导致附睾部位肿胀，甚至引起疼痛，如果走动牵扯到附睾甚至会导致剧痛难忍，临床触诊可以互相发现附睾那儿有硬块。
附睾炎按病程可分为急性附睾炎和慢性附睾炎两种。急性附睾炎多继发于尿道、前列腺或精囊感染，慢性附睾炎常由急性期治疗不彻底而引起。过早使用热疗可加重疼痛并有促进感染扩散的危险，所以早期宜用冰袋局部冷敷。性生活和体力劳动可加重感染，故应避免。
附睾炎在临床上分为急性附睾炎和慢性附睾炎两类。急性附睾炎表现为突然高热，白细胞数升高，患侧阴囊胀痛、沉坠感，下腹部及腹股沟部有牵扯痛，站立或行走时加剧。患侧附睾肿大，有明显压痛。炎症范围较大时，附睾和睾丸均有肿胀，两者界限触摸不清，患侧的精索增粗，亦有压痛。慢性附睾炎较多见。病人常感患侧阴囊隐痛，有胀坠感，疼痛常牵扯到下腹部及同侧腹股沟，有时可合并继发性鞘膜积液。