手术过程中会使用麻醉药，过程中不会感觉到疼痛，但是术后大约会持续疼三天左右时间。术后要做好术后护理，预防感染和禁止性生活一个月。包皮过长容易诱发各种炎症，损伤阴茎海绵体，诱发一些实质性疾病，影响到性功能。确诊后要及时的做手术治疗包皮过长。
包皮过长，进行手术一般没有明显的疼痛，具体分析如下：
如果是包皮过长，在手术中一般不会感觉到疼痛，成年人可以使用局麻，而儿童则可以使用全麻，局麻就是在注射麻药的一刹那会感觉到疼痛，而全麻则是通过静脉注射麻醉剂，因此，在手术的过程中，病人并不会感觉到任何的痛苦。在做完包皮手术后，麻醉药物逐渐代谢完成后会有疼痛感，一般是可以忍受的。如果疼痛的临界值不高，可以服用芬必得等镇痛药物。
包皮过长一般不会引起睾丸疼痛，但是包皮过长本身是不好的，可以引起包皮龟头炎，到前列腺炎和睾丸炎，进一步会导致睾丸疼痛。及时去医院检查，对症治疗，平时注意穿宽松的内裤，勤洗内裤，避免感染。
多见于包皮炎、龟头炎等导致，可以先使用洁尔阴清洗，另外可以外用软膏等药物治疗，也可以到医院皮肤科就诊检查，根据病情采取药物治疗，注意卫生，暂停性生活，如果有手淫要戒除。另外注意是否有包皮过长，如果有包皮过长，也可以采取包皮环切术治疗。
男性包皮手术在进行手术时是不会感到疼痛的。
做包皮过长手术时，第一步都要给男性注射局部麻醉，随着麻醉的效果起效，进行手术时就不会感觉到疼。但是随着药效失效，患者会逐渐感觉到疼痛，一般情况下，这种疼痛患者是可以忍受的。对于疼痛敏感的患者，必要时可采取口服布洛芬缓释胶囊进行止痛，切口逐步愈合，疼痛感也随之减小。
通常是没有痛苦的，因为打麻醉药的，包皮过长因长期的尿液、包皮垢的慢性刺激，可使包皮龟头粘膜水肿、充血、糜烂、反复交叉感染甚至发生包皮嵌顿，导致包皮龟头坏死等严重后果。