孕妇若患甲状腺功能减退疾病，将影响胎儿智力发育、增加出生缺陷几率。如果现在怀孕后，有甲状腺功能异常的话，那这个是属于内分泌失调，一般是及时的用药调理到正常范围，及时纠正，规范治疗，那就不影响胎儿的发育。
孕妇甲减会对胎儿先天性发育障碍。
甲减会影响宝宝的智力发育、神经反应能力及运动能力等。这是因为甲状腺是人体重要的内分泌器官，其分泌的甲状腺素参与身体的生长发育和各器官系统的代谢调节，其中，也是胎儿脑神经发育所必须的激素。所以孕妇的甲状腺功能对于胎儿的生长发育影响比较大，因此孕期需要检查甲状腺功能，判断是否在正常范围以内。
妊娠期间甲减对孕妇的作用与甲减的严重程度有关，遗传的甲减会对胎儿的发育造成一定的不良反应，从而造成胎儿的生长发育滞后，甚至有可能造成流产的危险。
亚临床甲减是不是引起怀孕的原因，目前还没有定论，但在怀孕初期出现甲减，特别是临床性甲减，会对胎儿的长期智能产生一定的负面作用。总之，妊娠期间甲减对胎儿的影响，与怀孕期间的甲减有很大关系。
孕妇甲减可以导致胎儿甲状腺发育缺陷，也可造成胎儿死亡，最主要的是造成胎儿甲状腺激素减少。甲状腺激素是维持机体正常生长发育不可缺少的激素，胎儿的甲状腺功能在妊娠第12周开始建立，妊娠前半期胎儿大脑发育所需要的甲状腺激素完全或主要来自母体，孕妇的甲状腺素特别是对胎儿的脑的发育尤为重要。
甲减孕妇如果控制不好，对胎儿智力有影响，将甲状腺功能控制到正常人上限为宜，即将游离T4控制到正常上限比较合适，主要预防由于服用过多药物导致甲减引起胎儿的智力异常，影响胎儿智力发育。