尿检非鳞状上皮细胞高是由于白细胞异常增生引起的，属于一般性炎症，可能导致出现尿路疼痛、有灼烧感等现象，甚至有可能造成严重的感染，导致尿道炎，输尿管炎，膀胱炎，肾炎等疾病的发生。
正常的尿路被覆移行上皮细胞，仅靠近尿道口处覆盖有少量的鳞状上皮细胞。尿检时，尿液中出现鳞状上皮细胞增多，是在收集尿液标本时，男性没有上翻包皮，女性没有清洗外阴，使包皮垢或白带混入尿液所致。
小便当中非鳞状上皮细胞增高，说明存在膀胱黏膜病变的可能性是很大的。需要进一步的检查膀胱镜，通过膀胱镜活检能够明确是否存在膀胱黏膜病变，然后再针对性的治疗。如果只是普通的慢性膀胱黏膜炎症，口服药物，对症治疗就可以了。如果是比较严重的膀胱黏膜异型增生，需要经过经尿道膀胱黏膜电切手术治疗，才能治好。
鳞状上皮细胞高，表示此阶段雌激素水平较高。阴道及宫颈阴道部上皮的鳞状上皮相仿，为非角化性分成鳞状上皮。上皮细胞分为底层、中层及表层，其生长与成熟与卵巢雌激素有关。女性一生中不同时期及月经周期中不同时间，各层细胞比例均不相同，细胞由底层向表层逐渐成熟。
鳞状上皮细胞癌在进行检查的时候出现抗原升高，说明癌症复发，因为本身抗原属于一种肿瘤标志物，如果是进行血液检测的时候出现了明显的抗原升高，癌症复发并且达到中晚期的概率相对较高，仅仅通过抗原升高是无法确诊的，需要进一步进行病理学检查才能确诊。
鳞状上皮细胞偏高，基本是由膀胱的病变和炎症引起的，正常来说鳞状上皮偏高，通常是在尿常规检查的时候出现的一种现象，主要考虑的是有膀胱粘膜的病变，或者是有妇科的慢性炎症的几率性比较大。进一步的检查，明确是否有细菌感染。