男性性功能障碍包括勃起问题、射精等，需要选用不同检查方法进行检查。
例如，以某种量表的形式请患者填写，对其某些心理问题或者对其性生活某些情况有了初步认识，除其他外，也有经过实验室考察，实验室要经过几次血液检查，例如性激素，甲状腺功能，血脂等、血糖和其他这些都会影响勃起功能。当然也可以检测前列腺液和精液中精子数等。另外就是进行了前列腺液化验后再去看，一般都能查出阳性结果。
也有一些是通过对阴茎血流动力学进行检查，例如向阴茎内注入一些血管扩张剂药物以进行b超检查，对阴性血管血流状况进行调查。
性功能障碍，比如勃起功能障碍、阳痿，常见的检查就是抽血查性激素和阴茎血流检查，或者阴茎海绵体的彩超检查、阴茎动脉造影检查。如果是早泄，B超检查前列腺精囊，或者按摩前列腺液检查；有些可能也查一下内分泌激素，比如甲状腺激素测定。
性功能障碍的检查项目有：生化检查：血、尿常规、肝功能、肾功能、血糖、血脂等常规检查，可以做性激素检查、精液常规、宫颈液常规检查；影像学检查：主要是针对生殖器官的超声、CT、MR检查；特殊检查：勃起功能障碍可以进行视觉刺激测试、夜间阴茎勃起功能测定、勃起功能刺激试验等。
生化检查，血、尿常规、肝功能、肾功能、血糖、血脂等常规检查，根据特殊情况，可以做性激素检查、精液常规、宫颈液常规检查。影像学检查，要是针对生殖器官的超声、CT或者是MR检查。特殊检查，根据病因进行针对性检查。
男性勃起功能障碍的检查项目分为有创、无创两类，无创检查包括性激素全套、NPT，也称夜间勃起功能检测，通过NPT机器可检测勃起状态。正确认识男性勃起功能障碍，偶尔勃起不良，不代表性功能、勃起功能异常。
性功能障碍的检查一般是包括勃起功能方面的检查和龟头敏感性的检查，另外还包括前列腺液常规检查，尿常规检查，阴茎血管彩超检查等。从这些检查可以用来判断性功能障碍是否是器质性还是心理因素所引起的。