如果发生明显的尿路梗阻就需要手术治疗。对于手术治疗之后，如果完全恢复之后是没有什么副作用的，只是在手术恢复期的时候，可能会有一些疼痛和难受的症状，但都可以在承受的范围之内。
手术后会出现排尿困难，可能造成勃起功能障碍以及射精障碍，膀胱过度活动症会导致膀胱的有效容积减少，术后可能会出现尿频，如果手术过程中损伤到括约肌，可能出现尿失禁。
排尿困难：如果术前未做尿动力分析，将无法了解逼尿肌的状态，手术可能会导致患者出现排尿困难。性功能减退：手术可能造成勃起功能障碍以及射精障碍。尿频：膀胱过度活动症会导致膀胱的有效容积减少，患者术后可能会出现尿频。尿失禁：如果手术过程中损伤到括约肌，患者可能出现尿失禁。
前列腺增生手术后遗症临床上叫手术的并发症，就是手术后会并发什么情况。第一是术后的出血，需要进行持续的膀胱冲洗，在开始的时候，另外在远期来说会合并前列腺的瘢痕形成，后尿道的再次狭窄，甚至有二次手术的可能性。
前列腺增生微创手术会有后遗症，手术切的太少可能还会导致梗阻，比如排尿不通畅达不到满意效果，手术切的过多，比如将尿道括约肌损伤，可能会导致尿失禁，还有并发炎症、感染、出血，都是前列腺微创手术的并发症。
做完前列腺增生切除手术一般没有后遗症。
做完前列腺增生切除手术通常不会有任何后遗症。前列腺增生手术恢复期，手术方式的不同，或多或少都会对性功能产生一定的影响，如手术经尿道者有逆行射精者，耻骨上膀胱手术大多数人逆行射精，经会阴部手术阳痿发病率高。另外一部分患者由于年龄较大或患有慢性疾病导致性欲低下和性冷淡，也可能引起性方面的问题。多数人在康复修养后，性功能可以得到恢复，不明显影响夫妻生活。患者对于前列腺增生的治疗，必须要有足够的心理准备。