通常情况下，需要根据囊肿的严重程度来确定怀孕时间。
巧克力囊肿是由于子宫内膜异位到卵巢上生长而导致形成的，如果病情不严重，手术后一个月复查，身体恢复正常，来过1-2次月经可以怀孕。
如果病情较严重，术后可能会使用药物继续保守治疗，如GnRHa针，可预防巧克力囊肿再次复发，也可以让卵巢充分的时间休息，用药过程大约3-6个月，等待停药后月经恢复正常后怀孕，受孕率更高。
一般手术三个月后再开始备孕。术后要注意不可以随便服用药物，尤其是激素类的药物，可以多吃些高蛋白高营养的食物，增强体质。建议平时注意少吃生冷辛辣刺激性的食物，注意腹部保暖，避免身体受风着凉，不要过度劳累和熬夜。
巧克力囊肿手术后尽量过三个月再开始备孕。手术之后排球的创面需要恢复1到2个月，这一两个月之内是不能够受孕的，但是这一两个月之内内异症病灶容易复发，所以术后要用三个月的药物治疗，这三个月的药物治疗，能够把残留的病灶进一步的沙面，同时能够预防复发，治疗三个月之后，只要恢复月经就可以尽快怀孕。
巧克力囊肿是子宫内膜异位症的表现之一，这种病是有可能影响生育，刚做完手术后半年内怀孕最合适，考虑刚做完手术的原因，所以可以考虑两个月在做备孕的准备，个人身体因素不同具体时间也因人而异，手术后如果感觉回复的不错，可以到附近正规医院做一个检查，遵医嘱。
3-6个月。做完巧克力囊肿手术之后，子宫和附件还没有完全恢复，要注意休养一段时间。手术后，建议至少三个月在怀孕，让伤口有很好的修复，另外巧囊手术后半年到一年怀孕几率还是比较高的。
巧克力囊肿术后试孕越早越好，怀孕机会越大，麻醉药物在术后半个月时体内残留量所剩无几，待到卵子排出，受精卵形成时，对胚胎的影响可以忽略不计，如为腹腔镜手术，可B超监测卵巢卵泡，卵泡大小一厘米左右即可备孕。如为经腹手术，术后一月即可备孕。