巧克力囊肿并不需要切除子宫和卵巢的，只是做好囊肿摘除手术就可以了，子宫对于女性身体的重要性是很大的，不能轻易的切除，这样是会影响到身体健康的，这一点是不能有任何的忽视的，检查工作，一定要做好，以减少风险性，术后的复检也是需要做好。
治疗巧克力囊肿不一定要切除卵巢，需要根据病人的具体情况来定。巧克力囊肿是女性患有子宫内膜异位症的一种病变，巧克力囊肿的发生主要是由于女性在月经期间出现子宫壁脱落出子宫内膜碎片引起引流不畅，导致经血不能完全从阴道排出，有少量的经血经过输卵管向盆腔倒流，从而发生血瘀，种植在卵巢表面或盆腔其他部位，形成异位囊肿。
可以，巧克力囊肿是由于有炎症的长期刺激和子宫内膜异位生长引起的。会随生理期周期性的脱落出血疼痛。主要临床表现就是引起月经量多，不规则出血，痛经等。有生育要求的可以保守治疗。症状严重者可以手术，囊液抽吸，性激素治疗等。
痛经为主要症状，为继发性且逐年加重，月经过多，月经血量多，也是临床常见症状之一，一般月经周期规律表现为经血过多或带经日久。性交痛：子宫直肠窝阴道后穹隆，宫骶韧带等部位的子宫内膜异位症均可发生性交痛，而且常于月经前较为明显。不孕。
巧克力囊肿怎样食疗，巧克力囊肿损害女性卵巢正常功能，若不及时治疗很容易诱发不孕症出现，尽要治疗。巧克力囊肿多吃一些羊血、螺狮、淡菜、乌贼、荠菜、藕、蘑菇等食物，对治疗进程有一定帮助。
巧克力囊肿如何检查问题，需要做的检查有：阴道后穹隆穿刺。这种检查可以抽出咖啡色或者是巧克力色浑浊液，甚至有的是血性液体。抗子宫内膜抗体，这是一种以子宫内膜为靶抗原，可以引起一系列的免疫病理反应的一种自身的抗体，是子宫内膜异位症的一个标志抗体。B型超声检查。这种检查方法可以看见附件区和子宫密切相连的地方有一个轮廓不规则的囊腔，其液性暗区中充满弥漫性的杂乱细回声，或者是不均匀的片状回声。