如果在有卵巢囊肿的情况，只是进行推拿的治疗，效果不理想，现在囊肿比较小的情况下，可以服用中药进行治疗。如果现在卵巢囊肿比较大，可以在月经干净3-7天以后，去医院做腹腔镜的微创手术治疗。
发现较大的卵巢囊肿是会引起尿频、排尿不畅的。较大的卵巢肿胀可采用腹腔镜或者开腹手术两种方式进行，多采用手术切除囊肿，尽量保留卵巢组织；切除的囊肿组织送病理检查；根据结果进一步明确囊肿性质。若为良性肿瘤，手术基本可以治好；若为恶性肿瘤，手术后还需化疗等后续的治疗措施及随访。
卵巢囊肿分为生理性卵巢囊肿以及病理性卵巢囊肿，功能性性卵巢囊肿也就是生理性卵巢囊肿，月经干净后或三个月以后去医院复查就可以。出现外阴瘙痒，盆腔积液增多的情况，有可能与妇科炎症有关。
功能性卵巢囊肿手术的费用，每家医院因收费标准不一样，所以无法给出具体费用是多少。卵巢囊肿的手术，需要根据病人的年龄、生育要求及对侧卵巢的情况，决定手术范围。年轻的、单侧的肿瘤，行患侧卵巢肿瘤切除术或者卵巢切除术，保留同侧正常的卵巢组织和对侧的正常卵巢。
功能性卵巢囊肿不严重。一般生理性卵巢囊肿是不需要治疗的，会随着月经周期的变化时而出现时而消失。子宫内膜异位囊肿（巧克力囊肿）如果手术后复发也可选择药物治疗，如果是持续存在的囊肿或者有增大趋势的囊肿或恶性肿瘤则需要手术治疗。
卵巢囊肿分为生理性卵巢囊肿以及病理性卵巢囊肿，功能性性卵巢囊肿也就是生理性卵巢囊肿，一般可自行消失，月经干净后或三个月以后去医院复查就可以。出现外阴瘙痒，盆腔积液增多的情况，有可能与妇科炎症有关。