多囊卵巢需要看是否有生育要求来定，还需要看病情的程度和临床表现来定治疗方案的，应控制饮食，增加运动降低体重和腰围，药物治疗，调经降雄激素及胰岛素水平，促排卵或手术治疗，腹腔镜下行多囊卵巢打孔术，提高排卵率和妊娠率。
多囊卵巢的治疗上主要以激素调节为主。首先要做相关的检查，于月经第2-3天行性腺六项、血糖及胰岛素抵抗的检查，根据检查结果进行针对性的治疗。可以通过口服天然雌激素与孕激素药物进行正常的人工周期调节，如果存在排卵异常情况，也可以通过促排卵治疗达到排卵的目的。
多囊卵巢可以经内分泌科先药物调理，如果必要时可能要更进一步治疗，比如卵巢打孔等，主要看看卵巢囊肿的大小，如果是超过五公分的，一般需要采取手术治疗，多吃清淡的食物，多吃蔬菜水果。保持营养的均衡，多吃一些蔬菜类的，比如白菜，黄瓜，西红柿，紫甘蓝，芹菜等，水果类的可以多吃一些哈密瓜，香蕉，苹果等。
病人应该尽量调整自己的情绪，尽快到正规医院进行检查，观察病情，开正确的药。大多数囊性卵巢综合征病人在减肥后可以通过调整生活方式自愈，只有少数顽固性病例需要医疗干预。
多囊卵巢囊肿可以是生理性的（即是正常的随生理周期的变化可以自然消失的）或病理性的（由于疾病而形成的囊肿），生理性的囊肿无需手术，而病理性的囊肿，往往需要手术来明确诊断并作相应的处理。