大于5厘米的卵巢囊肿需要手术，因为囊肿太大而不会引起并发症，如蒂扭转、出血、破裂和感染。如果分娩需要怀孕，分娩时可以通过剖腹产摘除囊肿。如果不需要分娩，囊肿可以通过腹腔镜或剖腹手术切除。
卵巢囊肿如果是生理性并且囊肿在5厘米以下不算严重，如果发现囊肿大于6厘米，并且有逐渐增大的现象，就建议及早住院进行手术治疗了。卵巢囊肿是不会有生命危险的。
卵巢囊肿是一种良性的病变，如果把他脑子的体积不大，比如在5公分之内，还有自限性，对怀孕影响不大。对于伴有月经不调的应积极调理月经，往往会发生一些不良的后果，像腹痛、扭转、感染，还有极个别的发生恶变，会因为对内分泌和排卵的影响而导致不孕。
多囊卵巢和卵巢囊肿相比，多囊卵巢更为严重。是因为多囊卵巢属于内分泌疾病，常常是由于遗传因素和环境因素相互作用导致的，由于卵泡不能正常生长发育和排出，因此就会导致女性出现月经失调、面部痤疮，甚至肥胖等其他并发症，还可能影响女性的生育功能。卵巢囊肿可能是生理性囊肿，也可能是普通的卵巢囊肿，或者是子宫内膜异位症导致的卵巢巧克力囊肿这些疾病通过手术治疗以后往往都可以治愈，而且不容易影响女性正常受孕。
5厘米的卵巢囊肿，不算是很大。
不过也有可能会发生一些并发症，比如扭转、破裂或者感染等。如果之前没有发现过这种情况，可以在月经干净以后再复查一下B超。如果消失了，说明这是生理性的黄体囊肿，不用治疗。如果囊肿经过彩超检查发现囊肿内有乳头状突起，并且伴有丰富的血流信号，此时行肿瘤标志物检查，发现肿瘤标志物明显升高，考虑囊肿可能有恶变的可能，这时需要行手术干预。
4厘米卵巢囊肿不算大。
4厘米卵巢囊肿比正常的鸡蛋大小还要小一些，患者一般不会有明显的自觉症状，也不会在下腹部摸到包块。一般而言，卵巢囊肿大于等于5厘米的时候才建议进行手术治疗。4厘米的卵巢囊肿如果没有明显症状的话，是不建议进行特殊处理的，只要随访观察即可。患者需要每个月复查一次妇科B超，观察囊肿的大小和性质有没有变化。