巧克力囊肿手术一般为微创手术，通常一周左右可以恢复正常饮食，没有什么明显的饮食禁忌，对于新鲜的水果、蔬菜、鱼、虾、瘦肉、鸡蛋、牛奶均可以食用。但是对于比较特殊的食物，比如豆制品、豆浆、蜂王浆，尽量减少食用或者是不食用，因为此类食物中含有雌激素，会对子宫内膜异位的囊肿有一定的影响。
一般手术三个月后再开始备孕。术后要注意不可以随便服用药物，尤其是激素类的药物，可以多吃些高蛋白高营养的食物，增强体质。建议平时注意少吃生冷辛辣刺激性的食物，注意腹部保暖，避免身体受风着凉，不要过度劳累和熬夜。
根据个人体质不同，时间自然也不一样。巧克力囊肿术后一般一个月就可以恢复。恢复的时间长短，和手术后的保养也有很大关系，所以术后要多休息，在恢复期间，定期到医院复查看恢复情况。
两小时之后就可以进食。巧克力囊肿术后，如果肠功能已经恢复，水果种类不限，跟平常一样，但避免出现腹泻的情况，但如果肠功能尚未恢复，暂时不宜吃水果，需流质饮食。建议术后注意休息，拔除尿管后可以适当下床活动，以减少盆腔粘连的几率。
巧克力囊肿是子宫内膜异位症的表现之一，这种病是有可能影响生育，刚做完手术后半年内怀孕最合适，考虑刚做完手术的原因，所以可以考虑两个月在做备孕的准备，个人身体因素不同具体时间也因人而异，手术后如果感觉回复的不错，可以到附近正规医院做一个检查，遵医嘱。
卵巢囊肿穿刺检查治疗本身对于妊娠是没有什么影响的，但卵巢本身可能会引起出现排卵异常和导致不孕的情况。卵巢囊肿的治疗原则在意一旦发现要及时给予手术治疗。仅仅是比较小的卵巢囊肿对于妊娠是没有什么影响的，穿刺后是不会影响怀孕的，所以在穿刺后是可以生小孩的。