先兆流产是由于胚胎发育不好，或是母体疾病，不健康的生活习惯等都有可能会引起流产。胚胎或胎儿染色体异常是先兆流产最常见的病因。孕妇患有全身性疾病，如严重感染、严重贫血、糖尿病、严重贫血也会导致先兆流产。
有一些女性即便是在怀孕期间，仍然有很多不良的习惯，比如酗酒，酒精当中所含有的大量乙醇会直接造成胚胎发育受损，对胎儿造成巨大的伤害，也会影响到胎盘和胎儿的血液循环，进而引发先兆性流产。
孕妇方面，包括内分泌功能失调如黄体功能不健，甲状腺功能不足等。胎儿方面的因素，则最突出的是受精卵的染色体异常了，约占整个流产儿的25%左右。外环境因素，整个妊娠期间的性生活应持谨慎态度，不恰当的性生活尤其是在早孕早期易引起流产。
妊娠不满28周内凡出现腹痛，阴道流血，宫颈扩张等症状，称为先兆流产，妊娠12周内为早期先兆流产，其后的称晚期先兆流产。究其原因，大体可分为孕妇及胎儿以及外环境影响几大方面。因素有胎儿方面和外环境因素等。
流产绝大部分的原因，在早期主要就是因为染色体的异常，也就是胚胎发育的异常造成的，是一种自然淘汰的过程。老是先兆流产可能是子宫内膜的发育有问题，或者是免疫系统的问题，还有一些其他的原因也可以造成一个反复的流产，需要及时看医生进行检查和治疗。
在怀孕早期如果孕妇出现腹痛和阴道出血的症状这属于先兆流产，引起先兆流产的原因是比较多的是因为在怀孕早期孕妇体内孕酮低引起的。另一个原因就是因为胚胎发育不良导致的自然淘汰，如果是因为孕酮低引起的是需要及时保胎治疗。