根据自身体内的激素水平，适量服用雌激素，服药后三个月要监测一次，有助于防治卵巢功能的衰退。促进身高，刺激乳房与生殖器发育，防治骨质疏松。吃富含植物性雌激素的食物，有助于改善因体内雌激素分泌不足对身体造成的影响。
先天性卵巢发育不全：性染色体异常比如Turner综合征，XO/XY性腺发育不全。性腺发育不全：比如46，XX单纯性腺发育不全，47，XXX性腺发育不全，这些疾病的病人就没有卵巢组织，其卵巢全部被纤维组织所取代。
卵巢发育不全的原因有：垂体问题：导致排卵异常的常见疾病，包括垂体泌乳素瘤、高泌乳素血症、及席汉综合征等，高泌乳素水平可抑制排卵。此外，下丘脑性不排卵原发性器质性因素、原发的功能性因素、继发性器质性病变、继发性功能性因素也可导致卵巢发育不全。
用含有雌、雄、孕三种激素作用的药物治疗，治疗期间每三个月监测一次，有助于治疗卵巢功能的不全。饮食治疗，可以每天喝牛奶，多吃鱼、虾、豆类、蛋类，这些食物富含植物性雌激素，有助于改善因体内雌激素分泌不足对身体造成的影响。可以服用补养药物。瑜伽调理，通过特殊的瑜伽运动和呼吸，帮助疏通女性器官的气血，促进血液循环，有助于调整荷尔蒙的分泌。
卵巢发育不全会出现月经不调，内分泌紊乱，伴随月经不调的症状，包括月经量少、经期延长、闭经等；肥胖、多毛，卵巢不好者，体内雄激素过多就会出现肥胖、多毛的症状；怀孕困难，卵巢功能不好，女性卵子生成和排出就会受到影响，不排卵或排出的卵子质量不好则会导致女性怀孕困难，即使怀孕也容易出现流产。
一般情况下，小儿先天性卵巢发育不全又叫特纳综合症，特纳综合症是一种性染色体病，这可能是父亲的精子或者母亲卵子发育异常，导致孩子体内只有一条X染色体引起的。如果小儿患有特纳综合症，可能会出现青春期不发育、原发性闭经、身材矮小等情况。临床上，对于特纳综合症的治疗，一般可以使用雌激素进行治疗。如果小儿患有特纳综合症，家长应及时带其去医院就诊，在医生指导下进行治疗，以免给身体带来更多不良的影响。
