通常情况下，卵巢巧克力囊肿的治疗方法有保守治疗、手术治疗等。具体情况分析如下：
保守治疗：卵巢巧克力囊肿是一种由于子宫内膜异位引起的疾病，如果症状比较轻，可以通过高效孕激素周期治疗、假孕疗法、假绝经疗法等保守方法进行治疗。
手术治疗：如果症状比较严重，保守治疗无效，可以通过手术尽量切除病灶；如果没有生育要求，可以直接切除子宫。
术后注意调整自己的情绪，保持乐观开朗的心态，使机体免疫系统的功能正常，手术后注意增加蛋白质的摄入量。蛋白质可以帮助伤口快速好，可以增加体力。选择鱼类，鱼肉比较容易消化和吸收。注意休息，禁食辛辣生冷刺激东西，适当活动，增强身体抵抗力。
卵巢巧克力囊肿指标有子宫直肠陷窝，可触及大小不等的不规则的结节状突起，触痛明显，子宫骶骨韧带增厚压痛。异位卵巢时常可触及一侧或两侧盆腔内有固定的囊性肿块，伴或不伴压痛。
如果说有卵巢囊肿，是不会影响到工作的，饮食上面要注意尽量不要吃辛辣刺激性的食物，有巧克力囊肿其实是可以通过规律的服用药物来治疗的。卵巢巧克力囊肿饮食宜多吃具有抗肿瘤作用的食物。
巧克力囊肿可以采用药物治疗和手术治疗两种方式治疗，治疗时一般要根据年龄、对生育的要求、囊肿的大小、病情的轻重来决定是采用药物治疗还是手术治疗，保守性的治疗主要是保留卵巢功能的治疗。
跟肥胖，压力大，休息不好，内分泌紊乱等方面有关，有性激素水平异常，排卵障碍，月经紊乱等症状表现。女性月经期一定要杜绝性生活。要注意自身保暖，避免感寒着凉。月经期间，禁止一切激烈体育运动及重体力劳动。随时调整自己的情绪，保持乐观开朗的心态，使机体免疫系统的功能正常。要去正规医院进行治疗，不要耽误治疗时期。