月经刚结束时发生肚子痛，很可能是因为盆腔炎症引起，发生盆腔炎时可表现为下腹痛，如炎症较严重，痛苦也就渐渐增加，甚至对胃肠道产生刺激作用，表现为恶心，呕吐和腹泻等。如果发生了输卵管妊娠和异位妊娠的话，肚子也会痛得厉害。如有子宫肌瘤，还可能导致肚子痛等病症，此外还有其他疾病，如急性阑尾炎等都可以引发肚子疼的问题。
针对不同病因进行对症处理，从而达到根治的目的，肚子痛才能消失。
腹痛但没来月经可能是怀孕、盆腔炎症、月经不调、宫颈黏连等情况。通常怀孕时月经就不会再来，随子宫得进一步变大，会牵扯到韧带导致腹痛。若排除怀孕后，可能是盆腔炎症导致的腹痛和月经不来的情况。另外精神紧张、压力大、劳累、熬夜等导致月经不调，也会有月经不来的情况。还有手术创伤导致的宫颈粘连，也会导致月经血在于宫腔内无法排出，引起腹痛、月经不来的情况。
一般情况下，月经期肚子疼可能是痛经，具体内容如下：
女性在来例假时会有腹部疼痛的症状，这是因为痛经的症状，主要有生理和病理两种。生理原因主要是由于经期气血不通畅、宫寒等原因造成的，这种情况可以用腹部的温度来调节，比如服用一些活血化瘀的红糖姜水，或是一些中药，这些都会随着时间的推移而逐渐消失。如果是病理性的痛经，可能与腺肌症、子宫腺肌症、骨盆内膜异位症有关。
来月经肚子疼腰疼在不影响正常工作和学习的情况下是正常的，因为通常在月经来潮前，由于盆腔内有淤血可能会导致小腹坠痛、腰酸困。建议女性在月经期间要注意保暖，如果腰疼的情况比较厉害，可以去医院检查是否合并有其他的疾病，查明病因后对症治疗，在月经期间避免吃辛辣的食物，避免吃生冷的食物，饮食尽量温软易消化，同时避免受凉。
月经过后肚子疼可能是体质虚弱、气血不足等原因引起的。
如果月经过后肚子疼，还存在腰酸、头晕等情况，则可能是由体质虚弱、气血不足、久病等原因引起的；脾胃虚弱也可能会导致月经过后肚子疼；此外，先天肾气不足、同房过于频繁等原因也容易导致月经过后肚子疼。建议患者平时注意保暖，少吃生冷食物，还需要前往医院进行诊治。
女性在月经后出现肚子疼痛，而且又是小肚子局部的持续性疼痛，可能是盆腔炎的可能性比较大。有可能是在月经期同房导致的盆腔感染，也可能是在月经时没有勤换卫生巾，而导致细菌上行性感染而引起。所以这时就需要赶紧去医院妇科检查彩超，并做妇科双合诊检查来确诊。如果是盆腔炎，青霉素不过敏的情况下，可以考虑服用青霉素和奥硝唑来进行抗炎止痛治疗。