手腕腱鞘囊肿的治疗方法有外科手术、针穿刺、日常调理等。
比较大的手腕腱鞘囊肿行外科手术，将囊肿的表层剖开，将其与皮下的神经分开，在伤口处进行了加压的处理，定期进行消炎处理。若囊肿接近于骨头等坚硬的组织，则可将其按压直至破裂，或用针穿刺，使其内物质被吸收。患者短期内应避免饮酒，遵医嘱做好相应的护理调整，进行良好的日常生活管理。
手腕部位腱鞘囊肿经挤压可破裂并能减轻。
腱鞘囊肿有许多是由关节产生的，可采用按摩、揉捏、试着能否使其进入关节腔的方法。还可设法将腱鞘囊肿顶入骨内，强行挤压可将囊肿击碎。但由于囊壁尚存在，此种治疗复发机会较多。建议到医院做手术彻底切除，效果会更好。
建议患者在日常不要自行挤破腱鞘囊肿，避免引发不适症状。
手腕腱鞘囊肿可以揉。
手腕腱鞘囊肿可以用手揉搓，通常情况下，采用手法处理，囊壁较薄，囊腔内压力大的囊肿，可以用手挤压，让囊腔里的液体排出来，以缓解症状，达到治疗手腕腱鞘囊肿饿目的。如果囊腔很厚，囊里的压力不大，可以用无菌针先刺穿，等液体完全排出来后再进行加压包扎。但如果出现了反复的腱鞘囊肿，则需要进行外科治疗。
手腕腱鞘囊肿挤破会好，但如果没有清洁护理，可能会导致感染的情况，反而加重病情。
腕腱鞘囊肿一般不会造成任何的临床表现，一般不会出现特别的表现，如果是肌鞘囊肿的体积不断扩大，可以用手指挤压，但今后也有复发的风险。也可以通过穿刺取出液体，注入激素，但也有可能出现反复，最好的办法就是外科切除，需要及时在正规医院接受治疗。
腕部有腱鞘囊肿，应属手外科范畴，亦可到骨科就诊，基本哪个骨科科室能有效治疗。
由于手腕部腱鞘囊肿所致，多数病例不出现显著症状，因此无需特别处理，但不能重复推拿按摩，忌手腕部活动过多，以免手腕部腱鞘囊肿屡遭磨擦，能有效地避免腱鞘囊肿扩大。若腱鞘囊肿渐大，引起局部疼痛等表现，甚至表现为血管神经受压，手术切除需主动完成。一般情况，对腱鞘囊肿行局部麻醉下手术摘除即可，通常不必住院治疗，门诊即可。
术后需保持刀口的清洁、干燥、加强换药、以免沾上水分，预防化脓性感染性疾病的发生，能有效地促进创面愈合。
左手腕腱鞘囊肿是一种良性疾病，因此左手腕腱鞘囊肿不严重。
但是，如果手腕部包块是脂肪瘤等，患者需要完善部分彩超检查，以判断囊肿大小及有无其它性质包块。对腕部腱鞘囊肿较小者可进行追踪观察。如囊肿大、影响局部活动度大，影响外观，可进行手术摘除。
患者平时注意降低腕关节，经常屈伸活动，这有利于降低手术后复发概率。