脑垂体增大可以密切观察，如果病情严重需要进行手术治疗。
大脑垂体变大需要根据患者的临床表现来确定，如果只是生理上的增长并没有特别明显的临床表现，那么可以先不进行手术观察。而当大脑垂体变大时，这种情况就是一种疾病导致的，有很大的几率会出现垂体瘤，这种情况下就必须通过外科手术，通常采用鼻蝶入路进行垂体瘤的切除。
脑垂体萎缩可以通过药物进行治疗。
脑垂体萎缩是一种引起垂体的功能下降的疾病，这种疾病会影响到垂体相应的激素水平，在治疗的时候，要先消除病因，然后再进行靶腺激素的长期替代治疗。比如垂体功能低下的第一步是补充肾上腺皮质激素，其次是肾上腺皮质激素，然后是甲状腺激素，可以从低剂量逐渐增加，如果是年轻的，可以进行性激素的补充。
治疗要明确是那种疾病再进行治疗，可以到正规医院内分泌科或外科就诊检查，根据病情采取激素类药物、手术、放疗等方法治疗。甲状腺-肾上腺皮质激素、性激素替代疗法，适用于全垂体功能衰退引起的多腺体功能减退者。垂体性闭经-手术和放射疗法垂体性闭经-食疗。
垂体囊肿可以通过手术去除，可以开颅手术采用额下外侧入路，另外一个是经鼻蝶手术，也就是通过鼻内镜手术。前者的手术创伤大，后者的创伤小一些。当然，囊肿是良性的病变，如果现在囊肿很小，没有影响垂体功能，是没有必要做手术的，这不会有什么特别的影响。只有囊肿非常巨大，对于垂体和视神经造成压迫出现明显症状的，才有必要做手术处理。
矮小症是一组因遗传或疾病因素导致的生长发育障碍性疾病，指儿童身高在相似生活环境下，低于同年龄、同性别正常儿童平均身高2个标准差，或身高每年增长低于4～5cm。矮小症是由多种原因引起的。建议到正规医院做核磁共振检查，垂体MRI可以清楚地显示垂体的形态和信号，这对矮小症的临床病因诊断、治疗方案制定、预后判断具有重要意义，是矮小儿童首选检查方法。
脑垂体矮小症可采用生长激素处理。
脑垂体矮小症也称生长激素缺乏症，就是因为生长激素的不足或者分泌不充分，造成生长缓慢，个子矮小。该病属于一种内分泌疾病，主要表现为智力发育迟缓，生长发育不正常等症状。脑垂体矮小症等，若为垂体肿瘤所致，视情况而定，可采用手术治疗，如垂体分泌不足等，可采用生长激素处理，通常从4~5岁开始，一直保持至骨垢融合，通常都能收到良好的疗效。