颅内蛛网膜囊肿，临床中大多患者不会出现任何不适，所以不需特殊处理，如果引起临床症状如头痛、恶心、呕吐、癫痫、视乳头水肿等表现，这类蛛网膜囊肿就需要去除，去除方法主要是通过手术。
蛛网膜囊肿一般需要及时进行手术治疗。蛛网膜囊肿分为两部分，一部分是在检测的时候意外被发现的，通常没有任何的临床表现，也不会对患者产生任何的伤害，因此不需要进行任何的处理。第二种是有征兆的，需要及时的进行手术，主要有两种：第一种是手术摘除。其次，就是将导管放在一个囊内，然后将导管穿过皮肤，放在其他部位，这样就能起到很好的作用。
目前临床上有很多小儿蛛网膜囊肿的手术治疗方法。
静态型蜘蛛网膜囊肿不会对周边脑部造成明显的压迫，如果持续时间较长，没有进展，则以非手术为主；囊肿较大、压迫脑组织、破裂出血、临床症状明显的患者，可以采用内镜下剥离开窗、显微镜下剥离开窗等方法，将囊肿中的脑组织与蛛网膜下的脑脊液进行沟通，以减少囊肿内部的压力，恢复脑组织的组织，逐步发展，逐步恢复到原来的水平。
可以手术切除，日常饮食少吃刺激性的食物，网膜囊肿首先应确定是否有增大的倾向，另外要确定是交通型的还是非交通型的，再要确定是否患有癫痫症状。若CT或MR证实蛛网膜囊肿有增大的倾向，且是非交通型的，或脑电图证实癫痫灶与蛛网膜囊肿位置一致均应手术治疗。
左颞叶蛛网膜囊肿主要包括原发性和继发性两类，不过这个囊肿多属于原发性，通常在体检时偶然被发现，不会造成任何的症状，因此不需要进行任何的治疗，而是要进行动态的观察，比如半年至一年进行一次头部CT或者头部MRI，看其是否已经发育成熟，如果已经成年或者周围的脑组织受到挤压，表现出了一些临床征象，应立即咨询专业医生进行治疗。
右额部蛛网膜囊肿如果小，没有压迫到周围的脑组织，是不需要处理的，如果太大，压迫到脑组织，导致出现各种神经或者自己活动异常的情况是需要通过手术治疗的，主要应该到神经外科就诊，做一个磁共振明确一下。因为囊壁具有分泌功能，所以完全切除囊壁是最合理的方法。