针灸治疗面瘫的穴位，急性期，以躯体穴位为主，如关元、中脘、天枢等，来祛风散寒、补益正气、提高免疫力。恢复期，以面目穴位为主，联合背部腧穴的刮痧，走罐治疗。后遗症期，以肢体穴位为主，如合谷、足三里、三阴交、太冲等。来调整阴阳平衡，增强抗病能力。
取手阳明大肠经的迎香、合谷穴，足少阳胆经的阳白穴。足太阳膀胱经的攒竹穴，手少阳三焦经的丝竹空、翳风穴，手太阳小肠经的颧髎穴，足阳明胃经的下关、颊车、地仓穴，足厥阴肝经可以取太冲穴，经外奇穴也可以取鱼腰、太阳、牵正穴。
在这种时期内的针刺的穴位选择主要以远端为主。局部用穴，脸上的穴位会选择比较少，甚至不选，更多的选择比方说躯体的穴位，进行祛风、散寒。腹部的穴位比如关元、中脘、天枢这样的穴位，去补益正气，提高病人的免疫力，尽快度过急性期的作用。
面瘫针灸取用穴位通常以面部局域穴位为主，主要包括前额部阳白穴、头部太阳穴、下眼睑四白穴、脸颊部下关穴、颧髎穴及鼻翼旁迎香穴、唇旁地仓穴、颊车穴以及下嘴唇承浆穴。
面瘫的病位于面部，按照经络的循行，针灸治疗面瘫一般以取局部腧穴以及手足阳明、太阳经穴为主，面部腧穴多取阳白，太阳、四白、颧髎、颊车、地仓等穴位。并且临床针灸治疗面瘫需要局部腧穴同时配合远端腧穴，远端一般取合谷穴。除以上主穴外，还可以辨证选穴，若鼻唇沟变浅，可以加迎香穴，若气血不足，可以加足三里、气海等穴，若人中沟歪斜，可以加水沟穴，若听觉过敏，可以加听宫穴，若舌前三分之二味觉丧失，可以加廉泉穴。