肾结石初期无明显的临床症状，随着疾病的进展，一般分为两种主要症状，一种是强烈的肾绞痛，另一种是血尿。
由于肾结石较大，可能会导致肾盂黏膜受到了破坏，从而引起血尿。如果有严重的表现，建议立即到泌尿外科就医，在日常生活中要多饮水、多排尿、多做运动，还需要到正规的医院进行解痉镇痛治疗，如果有必要的话要做进一步的检查。
肾结石早期可以没有任何症状，部分在结石活动时可以突然出现腰痛、血尿、尿频、尿急等情况。需要就诊于正规医院的碎石科或者泌尿外科，结石较小可以行剧烈运动，跑、跳等运动促进结石的早日排出。
肾结石早期的症状与结石的大小和位置有关。较小的肾结石，不存在嵌顿与肾积水，无任何症状及体征。较大的结石，如直径大于10mm，结石较大不会脱落入输尿管，有腰部酸痛不适，结石活动后可出现血尿。如果肾结石直径在5～10mm，结石碎片可能会脱落于输尿管中引起输尿管扩张，肾积水，可出现肾绞痛，血尿，伴尿频、尿急、尿痛，严重可出现腹痛、恶心、呕吐等不适。
肾结石的症状与结石是否活动有关，如果肾结石在肾盂里固定不定时，一般没有任何不适症状；肾结石在肾脏里活动，或者顺着尿液往外排，且卡在输尿管的某处，此时可出现剧烈的肾绞痛，可以向大腿内侧放射，并伴有尿频、尿急的症状，甚至出现一过性肉眼血尿，还可能出现全身大汗、恶心呕吐等迷走神经兴奋的症状。
肾结石症状可能是排尿痛，主要发生在腰、上腹部、肋骨的边缘与脊柱的交界处。
肾结石卡顿后会出现持续的疼痛，同时还会出现腰酸胀的症状，运动或者是工作都会导致疼痛加重。病情严重者可出现脸色苍白，出汗，血压低，甚至出现休克。出现恶心、呕吐、腹胀、便秘等症状。临床上比较常见的是血尿，尿液中有红细胞。主要表现为尿路感染、积水、腹部胀痛、尿频、尿急、尿痛、尿液中有少量的细小颗粒等。