主要临床症状是阴茎、包皮或者龟头出现轻度的发红，局部有豆腐渣样的分泌物，还会有淡红色的丘疹，伴有明显的瘙痒感。男性生殖器出现真菌感染，大部分是因为感染了念珠菌，可以诊断为念珠菌性包皮龟头炎，与自身患有糖尿病，或者长期使用激素类药物、免疫抑制剂等导致免疫功能下降有关系。
男性生殖器真菌感染一般是龟头和包皮的真菌感染，通常见于包茎或者包皮过长的患者。通常的症状可以见到阴茎头、包皮内板或者冠状沟处，也就是把包皮翻起来以后可以看到大量的、黏稠的、豆腐渣样白色污垢，洗干净了以后可能很快就会再次出现。另外可以看到阴茎头、冠状沟和包皮内板红肿，并且有红色的丘疹，有些患者会看到感染的皮肤和正常的皮肤有明显的分界线，会出现皮肤瘙痒，这种痒非常难以忍受，而且会有烧灼感。建议患者及时去医院就诊，明确具体情况，对症治疗。
包皮真菌感染的症状主要有：生殖器（包皮、龟头）部位痒、痛：如龟头痒、龟头痛、龟头小红点；阴囊痒、睾丸痒、睾丸胀痛；包皮龟头红肿、破溃、流脓；龟头上长痘痘等。尿频、尿急、尿痛等尿路系统症状，自觉尿道有灼热感，尿道内流出异常分泌物。生殖器长红斑、丘疹、水泡等症状，尤其是长米粒样、菜花样东西时，应高度警惕生殖感染的可能性。
手部真菌感染通常是指手癣，通常出现在手指指缝和手掌侧。手癣是一种常见的皮肤瘙痒，伴有脱皮、脱屑等症状。部分患者会先有明显的破溃、渗液、潮红等症状。也有部分患者会出现水泡，水泡破溃后会出现蜂窝样的糜烂面。局部真菌感染时间过长，会导致手部变得粗糙、干燥、角质增厚。
在临床上也有部分患者会出现手背上的真菌感染，但是如果是这种情况，一般都是以瘙痒、局部出现红斑、丘疹、脱皮、脱屑等为主。
一般真菌感染会导致生殖器和龟头表面有红肿痒，甚至有白色分泌物的现象。出现感染要到专业的皮肤性病科，检查阴茎和龟头上的脱落细胞，这样才能做出一个明确的判断。做细菌培养以后，有针对性的选择抗真菌的药物，一般一周左右恢复正常，如果包皮过长应手术治疗。