慢性扁桃体炎的早期症状主要为咽痛。慢性扁桃体炎以反复发作的咽痛为主要表现，可有咽内发干、发痒、异物感、刺激性咳嗽等轻微症状，有时还可出现口臭。如果扁桃体肿大，过度肥大的扁桃体可能会导致吞咽困难、说话含糊不清、呼吸不畅或睡眠时打鼾。
慢性扁桃体炎主要临床症状有，咽喉部不适，咽喉肿痛，有异物感，发干、发痒，口臭，扁桃体肿大，刺激性咳嗽等。慢性扁桃体炎为腭扁桃体的慢性炎症，是耳、鼻、咽、喉、头、颈外科临床上常见的多发病。
宝宝慢性扁桃体炎的症状如下：
会有反复发作的咽喉炎、疼痛，有的扁桃体过度肥大，会有说话含糊不清、吞咽困难、呼吸不畅、睡眠时打鼾、头痛、消化不良、四肢乏力、容易疲劳、低热等情况，可能还有口臭的症状。慢性扁桃体炎要系统规范地治疗，慢性扁桃体炎若长期反复发作，容易导致慢性并发症，如肾炎、风湿性关节炎、风湿性心脏病、长期低热等情况，要根据具体病因采取合理的治疗方案。
临床表现主要是反复发作性的咽喉疼痛，比如每次遇到感冒受凉、劳累或者是睡眠不好，或者是烟酒刺激之后，感到咽痛发作，并且有咽部不适以及阻塞感，还有扁桃体肿大，还有全身表现，主要是因为扁桃体内的细菌溶栓容易随着吞咽，进入消化道，从而引起消化不良，如果是细菌毒素进入到了体内，还会引起头痛、肢体乏力。
表现为经常清嗓。因为慢性扁桃体炎合并有慢性咽炎。慢性扁桃体炎扁桃体出现肥大，在睡觉时出现打鼾的症状，还会合并小儿腺样体肥大。另外小儿慢性扁桃体炎，有时会发生严重的并发症。
慢性扁桃体炎多是由于急性扁桃体反复发作，或者由于扁桃体窝内引流不长，窝内细菌病毒滋生感染而演变为慢性炎症，主要表现有咽痛，容易感冒以及急性扁桃体炎反复发作，平常自觉症状比较少，可有咽干、发痒、异物感、刺激性咳嗽等症状。如果扁桃体隐窝的分泌物有大量厌氧菌感染，可以出现口臭。