一般情况下，肥胖性心肌疾病是无法完全治疗的。根据左心室出道梗阻和不阻塞，肥胖症的病因可以划分为阻塞性和非阻塞性。梗阻心肌病变可以做外科治疗，但还是会出现心肌肥大的情况。非阻塞性肥厚型心肌病患者无症状、无其它并发症，可以在日常生活中避免过度劳累、戒烟戒酒、养成良好的生活习惯、定期做心脏彩超等，可以延缓肥厚型心肌病的病情发展。
一般情况下，如果单纯的肥厚型心肌病，没有发生流出道的梗阻，心功能较好，没有明确的胸闷心悸症状，则可以行中等强度以下的运动。
肥厚型心肌病患者可以做一些低强度的有氧运动项目，不能参加剧烈强度的比赛。低强度的运动包括高尔夫球、保龄球、双打网球、游泳、潜浮、溜冰、骑自行车、散步、徒步旅行和走步机运动等，一般不会影响身体健康。
肥厚性心肌病是不可以治疗的，只能够通过药物进行控制的。不及时走路可能会越来越重的，建议尽量的避免运动，休息为主，可以使用β受体阻滞剂等药物来进行治疗的。定期到医院通过心电图和心脏彩超检查看一下具体状况，平时一定要清淡饮食。
肥厚型心肌病是无法治疗的，主要是缓解症状、预防并发症。对于梗阻性的肥厚型心肌病，主要是降低血压差，可选用负性肌力药物的药物。对于不适用此药的病人可选用钙拮抗剂。对于合并终末期心衰的肥厚型心肌病病人，可使用一些强心药。
肥厚性心肌病患者可以选择药物或是手术治疗。
症状轻微的患者可以选择药物治疗来改善病情的症状，常见的药物有β阻滞剂，能够改善心肌供血，加上使用活血化瘀的中药，促进血液循环。严重的患者可能要采取手术治疗。肥厚性心肌病患者，一般通过心脏B超检查可以发现病情，主要是查看室间隔与左室后壁的比例，正常情况下是1公分，如果超过1.2公分，那么可能就会出现流血道的堵塞，引起晕厥、心脏骤停的情况。
此外，患者在日常生活中，要养成良好的生活饮食习惯，避免情绪波动。