手足口病多数都是先有发烧。手足口病是一种病毒感染，因此在潜伏期和疾病的早期，都会出现发烧。在没有皮疹出现之前没有特异性，所以经常会与其他的病毒感染症状相似。
不一定的，有的轻微的是间隔发烧，而且比较严重的是持续发烧，症状有发烧，厌食，皮疹，流口水，咽痛等症状，精神萎糜，呼吸浅速，心率加快，末梢循环不良这些症状时提示为重症手足口病，病程多数超过半个月以上。
手足口病如果患儿已经不发热了。表明该病处于恢复期，如果患儿已经不发热，还需看患儿的口腔黏膜溃烂是否修复，发病年龄多集中在五岁以下儿童，重度手足口多发生在三岁以下的儿童身上，特别是一岁以下的婴幼儿感染肠道病毒。
手足口病情况不会一直发热，病毒感染都会有个过程，7天左右可以自愈，所以不可能一直发热，除非引起神经系统疾病，如病毒性脑炎，或者是血液循环系统疾病如心肌炎等。
手足口病患者并不会出现反复发烧，它的发烧出现在手足皮疹出现之前，可以应用退烧药物降至正常。但是对于手足口病重症的患者，发烧很可能比较重一些，比如出现一直发烧，用退烧药物退不下来或者退下来之后，随即又上升到原来的温度并持续下去。
发烧肯定是坏事，手足口病是由多种肠道病毒引起，大部分手足口病患儿出现发热，最高可达40℃，但是部分患儿也可能单纯出现皮疹，而无发热。如果反复高热不退，或发热超过3天以上，有发展成危重病例可能，需要密切观察病情，及时诊断、治疗。