肛肠常规检查。看：看红肿范围，看齿线处有无黏液流出，籍此来判断内口位置。摸：指诊非常重要，无论是低位还是高位，指诊有时比B超还准确。血常规化验：通过血常规的检查，可以判断脓肿的严重程度。
首先要明确是否是肛周脓肿。可以行B超检查，有时也可行穿刺检查。如果肛周脓肿确诊了，手术治疗。如果只行脓肿切开引流，那么有一半的病人还会复发，即形成肛瘘。肛周脓肿病人宜食用清淡易消化的食品。忌食腥、辣刺激性食物。
去当地正规的大医院咨询后进行检查治疗。忌辛辣刺激食物，饮食清淡避免便秘，注意肛门清洁卫生，可以便后坐浴，定期医院肛肠科消毒换药，一般需要一月余愈合。还要注意检查。
脓肿切开后，用探针仔细检查内口，然后切开瘘口，适当切除皮肤和皮下组织，轻轻切除内口周围组织，使引流畅通。如果内口较深，瘘管穿过肛门括约肌，可采用拉线治疗。以上手术的优点是脓肿一期治疗，不形成肛瘘。然而，在急性炎症时，当很难找到内口时，不应盲目寻找，以免炎症扩散或形成假通道，只做切口和脓液，然后在肛瘘形成后再做肛瘘手术。二期手术的优点是效果准确，治疗率高。
日常生活避免辛辣刺激性食物，避免长时间久坐，在正确的指导下，可以通过局部抗感染，以及手术的方法进行治疗，同时要多积极锻炼身体，保持肛门清洁，勤换内裤，坚持每日便后清洗肛门，不要久坐湿地，以免肛门部受凉受湿，引起感染。
肛肠科的肛门镜检和指检，可以看出是否属于肛周脓肿及其分类；使用B超、CT、磁共振等先进仪器对其进行更深层次的检查，了解肛周脓肿的分类低位脓肿、高位脓肿和复杂程度，以及脓肿与肛门周围肌肉之间的关系，甚至发现深部脓腔和病变位置等。
