肛瘘手术属于小手术，比较简单，没什么痛苦，要去正规的公立医院肛肠科采取手术治疗，平时需要注意保持局部清洁卫生预防感染。不用担心，这种手术很简单，而且不会有疼痛感的。
肛瘘手术痛苦，手术治疗效果还是比较好的，术后可以口服消炎药物治疗。每天要用清水清洗肛门，温水坐浴。注意饮食，多喝水，多吃点易消化的食物，多吃点蔬菜水果，少吃油腻辛辣的食物，尽量保持大便通畅，防止便秘。平时注意自己的身体变化，出现异常，及时去医院进行检查。
—般无疼痛感，仅觉肛门口坠胀或坠痛，当脓液引流通畅后肿痛马上减轻。有时可因内口较大，粪便流入管道而引起疼痛，尤其是在排便时疼痛加剧。若外口暂时闭合，脓液积聚，可出现局部肿痛，并可伴发热，畏寒等全身症状；外口破溃脓水流出后，症状可迅速减轻或消失。
术后会感觉到肛周疼痛。因为肛周皮肤是齿状线下方，属于体神经支配的区域，对疼痛刺激敏感，通常是可以忍受的。可以选择应用温盐水坐浴的办法，能够缓解疼痛，手术以后也应该积极进行静脉抗感染治疗。
二级疼痛。肛瘘大多采用拔线手术，术后要定期绷紧线，这主要是为了保持橡皮筋的作用，可以起到慢性切割、绷紧线时有疼痛症状，一般一个月后肛瘘手术后要用橡皮筋绷紧线将基本拉紧。
肛瘘多采用挂线法，术后应定期收紧。这主要是为了保持橡皮筋起到慢性割伤的作用会出现疼痛症状。操作一个月后，橡皮筋会基本脱落。然而，如果有些病人肛瘘位置太高，时间可能会更长。